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Enregistrement W2156323098 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-4308

Abstract 4308: 3D nuclear telomeric signatures define circulating tumor cells (CTCs) and characterize CTC subpopulations in intermediate risk prostate cancer patients

2014· article· en· W2156323098 sur OpenAlexaff
Awe A. Julius, Adam P. Yan, Nidhi Shah, Klewes Ludger, Alexandra Kuzyk, Michael S. Xu, Ramy Boles, Jeff Saranchuk, Darrel Drachenberg, Sabine Mai

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensCancerCare ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCirculating tumor cellProstate cancerMedicineCancerProstateBiomarkerOncologyDiseaseInternal medicinePathologyCancer researchMetastasisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Intermediate risk prostate cancer is a current medical challenge since the patients in this group can either be stable or progress, and there is no predictor for individual risk. Stratifying these patients would spare the patients unnecessary treatment or indicate the start of treatment immediately without losing precious time. Currently, prostate specific antigen (PSA) is used as evidence for biochemical progression. A more sensitive biomarker is needed to detect disease progression earlier and more reliably. We have isolated circulating tumor cells (CTCs) using a filtration-based device (ScreenCell). We subsequently performed the genetic characterization of the captured CTCs on a single cell basis. Using three-dimensional (3D) nuclear telomere imaging and quantitative analysis of 3D telomeric signatures of CTCs, we have characterized CTCs in the blood of the patients and have identified patient subgroups with one or more groups of CTCs. 380 samples of intermediate risk prostate cancer all revealed the presence of CTCs. However, the CTCs found were not genetically identical. Marked heterogeneity was seen, and three main groups of CTC profiles were defined based on TeloView software our group developed earlier. Repeat samples taken 6 months intervals define stable, mildly changing and significantly altered 3D profiles indicative of disease stability vs. progression. Citation Format: Awe A. Julius, Adam Yan, Nidhi Shah, Klewes Ludger, Alexandra Kuzyk, Michael Xu, Ramy Boles, Jeff Saranchuk, Darrel Drachenberg, Sabine Mai. 3D nuclear telomeric signatures define circulating tumor cells (CTCs) and characterize CTC subpopulations in intermediate risk prostate cancer patients. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 4308. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-4308

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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