Abstract 4308: 3D nuclear telomeric signatures define circulating tumor cells (CTCs) and characterize CTC subpopulations in intermediate risk prostate cancer patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Intermediate risk prostate cancer is a current medical challenge since the patients in this group can either be stable or progress, and there is no predictor for individual risk. Stratifying these patients would spare the patients unnecessary treatment or indicate the start of treatment immediately without losing precious time. Currently, prostate specific antigen (PSA) is used as evidence for biochemical progression. A more sensitive biomarker is needed to detect disease progression earlier and more reliably. We have isolated circulating tumor cells (CTCs) using a filtration-based device (ScreenCell). We subsequently performed the genetic characterization of the captured CTCs on a single cell basis. Using three-dimensional (3D) nuclear telomere imaging and quantitative analysis of 3D telomeric signatures of CTCs, we have characterized CTCs in the blood of the patients and have identified patient subgroups with one or more groups of CTCs. 380 samples of intermediate risk prostate cancer all revealed the presence of CTCs. However, the CTCs found were not genetically identical. Marked heterogeneity was seen, and three main groups of CTC profiles were defined based on TeloView software our group developed earlier. Repeat samples taken 6 months intervals define stable, mildly changing and significantly altered 3D profiles indicative of disease stability vs. progression. Citation Format: Awe A. Julius, Adam Yan, Nidhi Shah, Klewes Ludger, Alexandra Kuzyk, Michael Xu, Ramy Boles, Jeff Saranchuk, Darrel Drachenberg, Sabine Mai. 3D nuclear telomeric signatures define circulating tumor cells (CTCs) and characterize CTC subpopulations in intermediate risk prostate cancer patients. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 4308. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-4308
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».