Species of <i>Tetrahymena</i> Identical by Small Subunit rRNA Gene Sequences are Discriminated by Mitochondrial Cytochrome <i>c</i> Oxidase I Gene Sequences
Notice bibliographique
Résumé
The mitochondrial cytochrome c oxidase 1 (CO1) genes of two isolates of each of the seven mating types of Tetrahymena thermophila were sequenced and found to differ by < 1% in nucleotide sequence and to be identical by putative protein sequence. As this gene was highly conserved in this species, the CO1 gene sequence was determined for four pairs of Tetrahymena species identical in their small subunit rRNA gene sequences. The following pairs of species showed from 1% to 12% divergence at the nucleotide level, enabling discrimination of all these species: (1) Tetrahymena pyriformis strain T and Tetrahymena setosa strain HZ-1; (2) Tetrahymena canadensis strain UM1215 and Tetrahymena rostrata strain ID-3; (3) Tetrahymena pigmentosa strain UM1285 and Tetrahymena hyperangularis strain EN112; and (4) Tetrahymena tropicalis strain TC-105 and Tetrahymena mobilis. However, because of the synonymous nature of the majority of substitutions, the pairs of species were identical based on the putative protein sequence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».