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Enregistrement W2157028755 · doi:10.1534/genetics.105.045641

The Purine Synthesis Gene <i>Prat2</i> Is Required for Drosophila Metamorphosis, as Revealed by Inverted-Repeat-Mediated RNA Interference

2005· article· en· W2157028755 sur OpenAlexafffund
Yingbiao Ji, Denise V. Clark

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésRNA interferenceBiologyDrosophila melanogasterGeneticsGenePhenotypeTransgeneMetamorphosisRNALarvaBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PRAT (phosphoribosylamidotransferase; E.C. 2.4.2.14) catalyzes the first reaction in de novo purine nucleotide biosynthesis. In Drosophila melanogaster, the Prat and Prat2 genes are both highly conserved with PRAT sequences from prokaryotes and eukaryotes. However, Prat2 organization and expression during development is different from Prat. We used RNA interference (RNAi) to knock down expression of both Prat and Prat2 to investigate their functions. Using the GAL4-UAS system, Prat RNAi driven by Act5c-GAL4 or tubP-GAL4 causes variable pupal lethality (48-100%) and approximately 50% female sterility, depending on the transgenic strains and drivers used. This observation agrees with the phenotype previously observed for Prat EMS-induced mutations. Prat2 RNAi driven by Act5C-GAL4 or tubP-GAL4 also results in variable pupal lethality (61-93%) with the different transgenic strains, showing that Prat2 is essential for fly development. However, Prat2 RNAi-induced arrested pupae have a head eversion defect reminiscent of the "cryptocephal" phenotype, whereas Prat RNAi-induced arrested pupae die later as pharate adults. We conclude that Prat2 is required during the prepupal stage while Prat is more important for the pupal stage. In addition, Prat and Prat2 double RNAi results in more severe pupal lethal phenotypes, suggesting that Prat and Prat2 have partially additive functions during Drosophila metamorphosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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