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Enregistrement W2157614078 · doi:10.1139/g07-069

GISH analysis of meiotic chromosome pairing in<i>Solanum lycopersicoides</i>introgression lines of cultivated tomato

2007· article· en· W2157614078 sur OpenAlexvenueno aff
Yuanfu Ji, Roger T. Chetelat

Notice bibliographique

RevueGenome · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésIntrogressionBiologyMeiosisChiasmaGeneticsChromosomePolyploidSolanumGenomeBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Meiotic chromosome pairing was studied in introgression lines of cultivated tomato, Lycopersicon esculentum (= Solanum lycopersicum), containing 1 or 2 chromosome segments from the wild species Solanum lycopersicoides. Genomic in situ hybridization (GISH) was used to compare the relative lengths at diakinesis of the different introgressed segments and to measure the chiasmate arm frequency for the chromosome pair involved in the introgression(s). Longer segments generally produced stronger GISH signals than shorter segments. GISH signal intensity also depended on whether or not an introgressed segment encompassed the centromeric region. For example, a 29 cM segment that included the centromeric region produced a stronger GISH signal than a 42 cM segment that did not. In each line the chromosome arm containing the homeologous segment showed a reduction in chiasmate arm frequency that was most pronounced in lines with long segments. This reduction was accompanied by an increased chiasmate arm frequency on the other arm. Double introgression lines, heterozygous in repulsion phase for 2 introgressions on opposite chromosome arms, showed a lower frequency of chiasmata than single introgression lines. Pairing failure, indicated by the presence of univalents, was highest in the double introgression and whole chromosome substitution lines. These results are discussed with respect to observations of suppressed recombination in these stocks and potential practical implications for reducing linkage drag in breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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