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Enregistrement W2158114680 · doi:10.4049/jimmunol.1001725

Granulysin Production and Anticryptococcal Activity Is Dependent upon a Far Upstream Enhancer That Binds STAT5 in Human Peripheral Blood CD4+ T Cells

2010· article· en· W2158114680 sur OpenAlexafffund
Junji Xing, Fuqing Wu, Shuai Wang, Alan M. Krensky, Christopher H. Mody, Chunfu Zheng

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésEnhancerBiologyGranulysinSTAT5Molecular biologyTranscription (linguistics)Transcription factorCell biologyIn vitroCytotoxic T cellGeneSignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have demonstrated that STAT5 is critical for expression of granulysin and antimicrobial activity. Because the signaling pathway and the resultant microbicidal activity are defective in HIV-infected patients, the mechanism by which STAT5 leads to granulysin expression is of great interest. In the current study, IL-2-stimulated CRL-2105 CD4(+) T cells expressed granulysin and killed Cryptococcus neoformans similar to primary CD4(+) T cells. The enhancer activity of the upstream element of the granulysin promoter was analyzed in primary CD4(+) T cells and CRL-2105 T cells with a luciferase reporter assay, and a STAT5 binding site, 18,302 to 18,177 bp upstream of the transcription start site, was identified as an enhancer. Additionally, the enhancer functioned in the context of heterologous SV40 promoter irrespective of its transcriptional orientation. Chromatin immunoprecipitation and EMSAs demonstrated that the enhancer element bound STAT5 both in vivo and in vitro, and mutation of the STAT5 binding site abrogated its enhancer activity. Furthermore, overexpression of a dominant negative STAT5a abolished the enhancer activity of the STAT5 binding site and abrogated the anticryptococcal activity of IL-2-stimulated primary CD4(+) T cells. Taken together, these data provide details about the complex regulation leading to granulysin expression and anticryptococcal activity in primary CD4(+) T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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