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Enregistrement W2158192817 · doi:10.1139/cjb-2014-0060

Speciation in North American water lilies: evidence for the hybrid origin of the newly discovered Canadian endemic <b><i>Nymphaea loriana</i></b> sp. nov. (Nymphaeaceae) in a past contact zone

2014· article· en· W2158192817 sur OpenAlexfundvenueaboutno aff
Thomas Borsch, John H. Wiersema, C. Barre Hellquist, Cornelia Löhne, Kim Govers

Notice bibliographique

RevueBotany · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaManitoba HydroUniversity of Saskatchewan
Mots-clésBiologyBotanyHybridCladeChloroplast DNATemperate climatePhylogenetic treeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Field observations of morphologically intermediate water lilies in central Canada suggested a hybrid origin involving the parents Nymphaea odorata Aiton and Nymphaea leibergii Morong despite the fertile nature of these plants. Sequencing of the nrITS and the plastid rps4–trnT–trnF regions further including all members of the north temperate Nymphaea subg. Nymphaea clade, and samples from other hybrids occurring in North America in the wild, allowed us to determine that individuals of N. leibergii and of N. odorata were the maternal and paternal parents, respectively. Hybrids of New England have all proven to be sterile, are genetically variable, and probably are F1. By comparison, the plants of east-central Saskatchewan and west-central Manitoba are fully fertile and genetically uniform based on ISSR and sequence data. On the basis of this evidence, the latter are here described as a new species, Nymphaea loriana sp. nov., which may have originated during the Holocene climatic optimum about 6000 years ago in a past contact zone of the parents. Further hybrids detected between N. odorata and Nymphaea tetragona Georgi, as well as between N. leibergii and N. tetragona, were always sterile. Gene trees of the temperate clade of Nymphaea converge on a clade of small-flowered water lilies (sect. Chamaenymphaea), including N. leibergii, N. tetragona, and Nymphaea pygmaea. Nuclear ITS further resolves an American clade (Nymphaea mexicana Zucc. – N. odorata) sister to all remaining species. This split into two major subclades also appears in the otherwise less resolved rps4–trnT–trnF tree. Thus the origin of N. loriana is a reticulation between long-separated parental lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,807
Score d'incertitude au seuil0,844

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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