<i>Aspergillus</i> galactose metabolism is more complex than that of <i>Saccharomyces</i>: the story of GalD<sup>GAL7</sup> and GalE<sup>GAL1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
Saccharomyces cerevisiae Hansen GAL1 (galactokinase) generates galactose-1-phosphate; GAL7 (galactose-1-phosphate uridylyltransferase) transfers UDP between galactose or glucose and their respective sugar-1-phosphate conjugates, and both are essential on galactose. Aspergillus nidulans ANID_04957 has 41% amino acid sequence identity with GAL1; ANID_06182 has 50% sequence identity with GAL7. The names Aspergillus nidulans GalE (galactokinase) and GalD (galactose-1-phosphate uridylyltransferase) are consistent with prior studies. Complemented galDΔ:ScGAL7 and galEΔ:ScGAL1 strains had wild-type phenotype, demonstrating functional homology. The galD5 and galE9 alleles were truncated. Strains galDΔ and galD5 were impaired on minimal medium containing 1% galactose (MM-Gal) at pH 7.5 and did not grow on MM-Gal pH 4.5. Strains galEΔ and galE9 grew on MM-Gal at both pH levels. Strains galDΔ and galEΔ produced wild-type conidiophores on minimal medium containing 1% glucose (MM-Glu) but few spores; for both, sporulation was lower on MM-Gal pH 7.5. GalD-GFP (green fluorescent protein) and GalE-GFP were cytosolic and upregulated on MM-Gal, consistent with quantitative real-time polymerase chain reaction. Galactofuranose immunolocalization in galDΔ resembled wild type on MM-Glu but was reduced on MM-Gal. The galEΔ strains had immunolocalizable Galf on all these media. Strains galDΔ and galEΔ were more sensitive to calcofluor, caspofungin, and itraconazole on MM-Gal. Neither galD nor galE is essential on galactose at high pH, implying additional routes for galactose metabolism in Aspergillus. Aspergillus galactose metabolism is more complex than that of S. cerevisiae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».