Cre Levels Limit Packaging Signal Excision Efficiency in the Cre/ <i>loxP</i> Helper-Dependent Adenoviral Vector System
Notice bibliographique
Résumé
Helper-dependent (HD) adenovirus vectors devoid of all viral coding sequences have a large cloning capacity and provide long-term transgene expression in vivo with negligible toxicity, making them attractive vectors for gene therapy. Currently, the most efficient means of producing HD vectors involves coinfecting 293 cells expressing Cre with the HD vector and a helper virus bearing a packaging signal flanked by loxP sites. Cre-mediated packaging signal excision renders the helper virus genome unpackageable but still able to replicate and provide helper functions for HD vector propagation. Typically, helper virus contamination is < or =1% pre- and < or =0.1% postpurification by CsCl banding. While these contamination levels are low, further reduction is desirable. However, this objective has not been realized since the Cre/loxP system was first developed. This lack of progress is due, at least in part, to our lack of understanding of the origins of the contaminating helper virus, thus rendering its reduction or elimination difficult to achieve. This study was designed to investigate the possible sources of contaminating helper virus persisting during HD vector amplification. The results revealed that Cre is limiting in helper virus-infected Cre-expressing 293 cells, thereby permitting helper viruses to escape packaging signal excision and propagate. The results of this study should provide a foundation for developing rational strategies to further reduce or possibly eliminate the contaminating helper virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».