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Enregistrement W2158815303 · doi:10.1093/molbev/msq199

High Rate of Large-Scale Hemizygous Deletions in Asexually Propagating Daphnia: Implications for the Evolution of Sex

2010· article· en· W2158815303 sur OpenAlexafffund
Sen Xu, Angela R. Omilian, Melania E. Cristescu

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology and Evolution · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationIndiana University BloomingtonUniversity of Windsor
Mots-clésBiologyDaphnia pulexMutation rateGeneticsAsexualityLocus (genetics)Evolution of sexual reproductionEvolutionary biologyMutation AccumulationDaphniaGeneZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The origin and maintenance of sex remains one of the most debated topics in evolutionary biology. Investigations of the molecular genetic consequences of asexuality, such as direct estimation of mutation and recombination rates in asexual lineages, are critical for explaining the prevalence of sex in nature. In this study, we use long-term mutation accumulation lines of asexually propagating Daphnia pulex and D. obtusa to examine the role of hemizygous deletion and ameiotic recombination (crossover and gene conversion) in the evolution of asexual taxa. Large-scale hemizygous deletions ranging from 2 to 30 kb are found to occur at a rate of 6.7 × 10(-5) locus(-1) generation(-1) in D. pulex, which is one order of magnitude higher than the rate of large-scale deletions in Saccharomyces cerevisiae and Drosophila melanogaster. A conservative estimate of gene conversion and crossing over in the apomictic germ line cells of Daphnia yields a rate of 3.3 × 10(-5) locus(-1) generation(-1). Our exceptionally high rate of large-scale segmental deletions suggests that the long-term survival of asexual Daphnia lineages is likely compromised by a high deleterious mutation pressure and that selection against deleterious mutations may play an important role in the evolution and maintenance of sex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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