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Enregistrement W2158824170 · doi:10.4161/cc.8.13.8883

Stable expression of miR-200c alone is sufficient to regulate TCF8 (ZEB1) and restore E-cadherin expression

2009· article· en· W2158824170 sur OpenAlexaff
Gregory J. Hurteau, J. Andrew Carlson, Eric Roos, Graham Brock

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologymicroRNAEctopic expressionRNA interferenceCadherinTransfectionMessenger RNACell biologyCell cultureTranscription factorEndogenyMolecular biologyCancer researchGeneticsGeneCellRNAEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regulation of the transcription factor TCF8 (ZEB1) by the microRNA miR-200c and was first identified using a bioinformatic and relative quantitative PCR based approach.(1) Using stable ectopic expression of miR-200c we then demonstrated loss of TCF8 (ZEB1) mRNA and restoration of its primary regulatory target, E-cadherin.(2) Recently, other members of the miR-200 'family' and an additional unrelated microRNA, miR-205, have been reported to be essential for the regulation of TCF8 (ZEB1) and restoration of E-cadherin.(3-5) To investigate, we repeated our initial method(s) and generated individual stable cell-lines, expressing the miR-200 'family' members; miR-200c, miR-200b, miR-141 and the related miR-205. Of these lines, miR-200b produced no mature transcript and miR-205 and miR-141 cells were either morphologically similar to controls or showed some slight changes respectively. However no reduction in TCF8/ZEB1 mRNA or restoration of E-cadherin could be detected in either line. In contrast, cells expressing miR-200c had a significantly altered morphology from mesenchymal to epithelial and restored expression of E-cadherin. These contrasting findings demonstrate that, as transient transfection is in essence an RNAi experiment, results should be treated with caution when investigating microRNAs and that an examination of microRNAs with similar seed regions requires stable ectopic expression to accurately reflect the endogenous mechanism(s).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,540

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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