Stable expression of miR-200c alone is sufficient to regulate TCF8 (ZEB1) and restore E-cadherin expression
Notice bibliographique
Résumé
Regulation of the transcription factor TCF8 (ZEB1) by the microRNA miR-200c and was first identified using a bioinformatic and relative quantitative PCR based approach.(1) Using stable ectopic expression of miR-200c we then demonstrated loss of TCF8 (ZEB1) mRNA and restoration of its primary regulatory target, E-cadherin.(2) Recently, other members of the miR-200 'family' and an additional unrelated microRNA, miR-205, have been reported to be essential for the regulation of TCF8 (ZEB1) and restoration of E-cadherin.(3-5) To investigate, we repeated our initial method(s) and generated individual stable cell-lines, expressing the miR-200 'family' members; miR-200c, miR-200b, miR-141 and the related miR-205. Of these lines, miR-200b produced no mature transcript and miR-205 and miR-141 cells were either morphologically similar to controls or showed some slight changes respectively. However no reduction in TCF8/ZEB1 mRNA or restoration of E-cadherin could be detected in either line. In contrast, cells expressing miR-200c had a significantly altered morphology from mesenchymal to epithelial and restored expression of E-cadherin. These contrasting findings demonstrate that, as transient transfection is in essence an RNAi experiment, results should be treated with caution when investigating microRNAs and that an examination of microRNAs with similar seed regions requires stable ectopic expression to accurately reflect the endogenous mechanism(s).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».