A molecular marker tightly linked to<i>P</i>, a gene required for flower and seedcoat color in common bean (<i>Phaseolus vulgaris</i>L.), contains the Ty3-<i>gypsy</i>retrotransposon<i>Tpv3g</i>
Notice bibliographique
Résumé
In common bean (Phaseolus vulgaris L.), the expression of color in flower and seedcoat tissues requires the dominant allele of the P gene. The fully recessive p allele completely suppresses color expression in these tissues, whereas in specific genetic backgrounds, the p(gri) allele potentiates a grayish-white seedcoat and pale violet (nearly white) flowers with two violet dots on the banner petals. As a first step to gaining a better understanding of this important gene, we phenotypically scored an F2 population segregating for P and p(gri) and subsequently screened contrasting bulk DNA samples with oligonucleotide primers to uncover random amplified polymorphic DNA (RAPD) fragments. OU3(2300), an RAPD marker linked in coupling phase to the dominant allele, mapped 1.3 cM from P. The core 'BAT93' x 'Jalo EEP558' recombinant inbred population was scored, and the marker mapped to linkage group B7. The segregating fragment was cloned, sequenced, and shown to possess significant homology to the Ty3-gypsy class of retrotransposons. We have named the element Tpv3g. It is estimated that about 100 copies of the element are present in the common bean genome. Phylogenetic analysis placed Tpv3g in the class A group of plant retrotransposons.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».