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Enregistrement W2159311291 · doi:10.1046/j.0902-0055.2003.00102.x

Two epithelial cell invasion‐related loci of the oral pathogen <i>Actinobacillus actinomycetemcomitans</i>

2003· article· en· W2159311291 sur OpenAlexaff
L. Li, Donco Matevski, M. Aspiras, Richard P. Ellen, Guylaine Lépine

Notice bibliographique

RevueOral Microbiology and Immunology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of Pennsylvania
Mots-clésActinobacillusBiologyOperonMutantMicrobiologyBacterial adhesinEscherichia coliPeriodontal pathogenPathogenWestern blotFibronectinMolecular biologyGenePorphyromonas gingivalisGeneticsCellBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two invasion-related loci, apiA and the two-gene operon apiBC, were isolated from the oral pathogen Actinobacillus actinomycetemcomitans UT32. apiA encodes a 32.5 kDa protein that migrates on SDS-PAGE as a 101 kDa protein as detected by Western blot analysis or silver staining of an outer membrane-enriched fraction of Escherichia coli transformants. E. coli expressing ApiA have a different phenotype than the host vector, in broth and on solid media, and a colony morphology that resembles that of fresh A. actinomycetemcomitans isolates. These E. coli transformants bound to chicken collagen type II, human collagen type II, III, V and fibronectin. apiB and apiC encode proteins of 130.1 and 70.6 kDa, respectively. ApiBC conferred on E. coli a slightly enhanced ability to bind to collagen type III. ApiA- and ApiB-deficient mutants were constructed in A. actinomycetemcomitans. The ApiB-mutant had 4-fold diminished invasion of KB cells; the ApiA-mutant had increased invasion. Both loci were found in all A. actinomycetemcomitans strains, although polymorphism was detected only for apiBC. The deduced sequences of these invasion-related proteins are homologous to members of the YadA adhesin/invasin family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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