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Enregistrement W2159738130 · doi:10.1093/eurheartj/eht571

Mendelian randomization of blood lipids for coronary heart disease

2014· review· en· W2159738130 sur OpenAlexaff
Michael V. Holmes, Folkert W. Asselbergs, Tom Palmer, Fotios Drenos, Matthew B. Lanktree, Christopher P. Nelson, Caroline Dale, Sandosh Padmanabhan, Chris Finan, Daniel I. Swerdlow, Vinicius Tragante, Erik P.A. van Iperen, Suthesh Sivapalaratnam, Sonia Shah, Clara C. Elbers, Tina Shah, Jorgen Engmann, Claudia Giambartolomei, Jon White, Delilah Zabaneh, Reecha Sofat, Stela McLachlan, Pieter A. Doevendans, Anthony J. Balmforth, Alistair S. Hall, Kari E. North, Berta Almoguera, Ron C. Hoogeveen, Mary Cushman, Myriam Fornage, Sanjay R. Patel, Susan Redline, David S. Siscovick, Michael Y. Tsai, Konrad J. Karczewski, Marten H. Hofker, W. M. Monique Verschuren, Michiel L. Bots, Yvonne T. van der Schouw, Olle Melander, Anna F. Dominiczak, Richard Morris, Yoav Ben‐Shlomo, Jackie F. Price, Meena Kumari, Jens Baumert, Annette Peters, Barbara Thorand, Wolfgang Köenig, Tom R. Gaunt, Steve E. Humphries, Robert Clarke, Hugh Watkins, Martin Farrall, James G. Wilson, Stephen S. Rich, Paul I. W. de Bakker, Leslie A. Lange, George Davey Smith, Alex P. Reiner, Philippa J. Talmud, Mika Kivimäki, Debbie A. Lawlor, Frank Dudbridge, Nilesh J. Samani, Brendan J. Keating, Aroon D. Hingorani, Juan P. Casas

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilU.S. Public Health ServiceUniversität UlmUniversitetet i OsloStockholms Läns LandstingUniversity of BristolKnut och Alice Wallenbergs StiftelseAgentschap NLHjärt-LungfondenAcademy of FinlandKarolinska InstitutetZonMwNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionResearch Councils UKBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute on AgingQueen Mary University of LondonNational Institute for Health and Care ResearchGovernment of the United KingdomWellcome TrustUniversity College LondonSahlgrenska AkademinBritish Heart FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftGlaxoSmithKlineEconomic and Social Research CouncilU.S. Department of Health and Human ServicesLondon School of Hygiene and Tropical MedicineEuropean Foundation for the Study of DiabetesAstraZeneca
Mots-clésMendelian randomizationSingle-nucleotide polymorphismMedicineAlleleInternal medicineCholesterolGeneticsGastroenterologyGenotypeBiologyGeneGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To investigate the causal role of high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) and triglycerides in coronary heart disease (CHD) using multiple instrumental variables for Mendelian randomization. METHODS AND RESULTS: We developed weighted allele scores based on single nucleotide polymorphisms (SNPs) with established associations with HDL-C, triglycerides, and low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C). For each trait, we constructed two scores. The first was unrestricted, including all independent SNPs associated with the lipid trait identified from a prior meta-analysis (threshold P < 2 × 10(-6)); and the second a restricted score, filtered to remove any SNPs also associated with either of the other two lipid traits at P ≤ 0.01. Mendelian randomization meta-analyses were conducted in 17 studies including 62,199 participants and 12,099 CHD events. Both the unrestricted and restricted allele scores for LDL-C (42 and 19 SNPs, respectively) associated with CHD. For HDL-C, the unrestricted allele score (48 SNPs) was associated with CHD (OR: 0.53; 95% CI: 0.40, 0.70), per 1 mmol/L higher HDL-C, but neither the restricted allele score (19 SNPs; OR: 0.91; 95% CI: 0.42, 1.98) nor the unrestricted HDL-C allele score adjusted for triglycerides, LDL-C, or statin use (OR: 0.81; 95% CI: 0.44, 1.46) showed a robust association. For triglycerides, the unrestricted allele score (67 SNPs) and the restricted allele score (27 SNPs) were both associated with CHD (OR: 1.62; 95% CI: 1.24, 2.11 and 1.61; 95% CI: 1.00, 2.59, respectively) per 1-log unit increment. However, the unrestricted triglyceride score adjusted for HDL-C, LDL-C, and statin use gave an OR for CHD of 1.01 (95% CI: 0.59, 1.75). CONCLUSION: The genetic findings support a causal effect of triglycerides on CHD risk, but a causal role for HDL-C, though possible, remains less certain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,074
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,160
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0740,160
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations792
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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