Direct Multiplex Assay of Lysosomal Enzymes in Dried Blood Spots for Newborn Screening
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Newborn screening for deficiency in the lysosomal enzymes that cause Fabry, Gaucher, Krabbe, Niemann-Pick A/B, and Pompe diseases is warranted because treatment for these syndromes is now available or anticipated in the near feature. We describe a multiplex screening method for all five lysosomal enzymes that uses newborn-screening cards containing dried blood spots as the enzyme source. METHODS: We used a cassette of substrates and internal standards to directly quantify the enzymatic activities, and tandem mass spectrometry for enzymatic product detection. Rehydrated dried blood spots were incubated with the enzyme substrates. We used liquid-liquid extraction followed by solid-phase extraction with silica gel to remove buffer components. Acarbose served as inhibitor of an interfering acid alpha-glucosidase present in neutrophils, which allowed the lysosomal enzyme implicated in Pompe disease to be selectively analyzed. RESULTS: We analyzed dried blood spots from 5 patients with Gaucher, 5 with Niemann-Pick A/B, 11 with Pompe, 5 with Fabry, and 12 with Krabbe disease, and in all cases the enzyme activities were below the minimum activities measured in a collection of heterozygous carriers and healthy noncarrier individuals. The enzyme activities measured in 5-9 heterozygous carriers were approximately one-half those measured with 15-32 healthy individuals, but there was partial overlap of each condition between the data sets for carriers and healthy individuals. CONCLUSION: For all five diseases, the affected individuals were detected. The assay can be readily automated, and the anticipated reagent and supply costs are well within the budget limits of newborn-screening centers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».