Mapping differentiation kinetics in the mouse retina reveals an extensive period of cell cycle protein expression in post‐mitotic newborn neurons
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Knowledge of gene expression kinetics around neuronal cell birth is required to dissect mechanisms underlying progenitor fate. Here, we timed cell cycle and neuronal protein silencing/induction during cell birth in the developing murine retina. RESULTS: The pan-cell cycle markers Pcna and Mcm6 were present in the post-mitotic ganglion cell layer. Although confined to the neuroblastic layer (NBL), 6-7% of Ki67(+) cells lacked six progenitor/cell cycle markers, and expressed neuronal markers. To define protein extinction/induction timing, we defined G2/M length throughout retinogenesis, which was typically 1-2 h, but <10% cells took double this time. BrdU-chase analyses revealed that at E12.5, Tubb3 (Tuj1) appeared at M-phase, followed by Calb2 and Dcx at ~2 h, Elavl2/3/4 at ~4 h, and Map2 at ~6 h after cell birth, and these times extended with embryonic age. Strikingly, Ki67 was not extinguished until up to a day after cell cycle exit, coinciding with exit from the NBL and induction of late markers such as Map1b/Uchl1/Rbfox3. CONCLUSIONS: A minor population of progenitors transits slowly through G2/M and, most importantly, some cell cycle proteins are retained for an unexpectedly long period in post-mitotic neurons. The high-resolution map of cell birth kinetics reported here provides a framework to better define mechanisms that regulate neurogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».