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Enregistrement W2161479848 · doi:10.1200/jco.2014.59.7401

Germline <i>BRCA</i> Mutations in a Large Clinic-Based Cohort of Patients With Pancreatic Adenocarcinoma

2015· article· en· W2161479848 sur OpenAlexafffundabout
Spring Holter, Ayelet Borgida, Anna Dodd, Robert C. Grant, Kara Semotiuk, David W. Hedley, Neesha C. Dhani, Steven A. Narod, Mohammad R. Akbari, Malcolm J. Moore, Steven Gallinger

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research Institute
Mots-clésMedicineOncologyFamily historyPancreatic cancerGenetic testingInternal medicineBRCA mutationCancerCohortSanger sequencingGermline mutationBreast cancerGenetic counselingOvarian cancerAdenocarcinomaMutationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The main purpose of this study was to determine the prevalence of pathogenic BRCA1 and BRCA2 mutations in a consecutively ascertained clinic-based cohort of patients with pancreatic ductal adenocarcinoma and describe the clinical and family history characteristics. PATIENTS AND METHODS: Unselected, consecutive, incident patients with pancreatic ductal adenocarcinoma were recruited at a single cancer center over a 2-year period. Participants provided blood for DNA analysis and cancer family history, and cancer treatment records were reviewed. DNA from all patients was analyzed by Sanger sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification for germline variants in BRCA1 and BRCA2. RESULTS: Three hundred six patients were eligible for analysis. Pathogenic germline BRCA mutations were identified in 14 patients (4.6%; 95% CI, 2.2% to 6.9%), including 11 patients with a BRCA2 mutation and three patients with a BRCA1 mutation. Having a cancer family history that met genetic testing criteria of the National Comprehensive Cancer Network or the Ontario Ministry of Health and Long-Term Care or self-reporting as Ashkenazi Jewish was significantly associated with BRCA mutation carrier status (P=.02, P<.001, and P=.05, respectively). However, the majority of the BRCA mutation-positive patients did not actually meet these genetic testing criteria. CONCLUSION: Pathogenic BRCA mutations were identified in 4.6% of a large cohort of clinic-based patients. Considering the implications for family members of BRCA carriers, and possibly tailored chemotherapeutic treatment of patients, our finding has implications for broader BRCA genetic testing for patients with pancreatic ductal adenocarcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,468
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations396
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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