Are Plasma Biomarkers of Immune Activation Predictive of HIV Progression: A Longitudinal Comparison and Analyses in HIV-1 and HIV-2 Infections?
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Chronic immune activation is a hallmark of HIV infection and has been associated with disease progression. Assessment of soluble biomarkers indicating immune activation provide clues into pathogenesis and hold promise for the development of point-of-care monitoring of HIV in resource-poor-settings. Their evaluation in cohort resources is therefore needed to further their development and use in HIV research. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Longitudinal evaluation of βeta-2 microglobulin (β-2 m), neopterin and suPAR soluble urokinase-type plasminogen activator receptor (suPAR) was performed with archived plasma samples to predict disease progression and provided the first direct comparison of levels in HIV-1 and HIV-2 infections. At least 2095 samples from 137 HIV-1 and 198 HIV-2 subjects with starting CD4% of ≥ 28 and median follow up of 4 years were analysed. All biomarkers were correlated negatively to CD4% and positively to viral load and to each other. Analyses in subjects living for ≥ 5 years revealed increases in median β-2 m and neopterin and decreases in CD4% over this period and the odds of death within 5 years were positively associated with baseline levels of β-2 m and neopterin. ROC analyses strengthened the evidence of elevation of biomarkers in patients approaching death in both HIV-1 and HIV-2 infections. Regression models showed that rates of biomarker fold change accelerated from 6-8 years before death with no significant differences between biomarker levels in HIV-1 and HIV-2 at equal time points prior to death.An 'immune activation index' analysis indicative of biomarker levels at equivalent viral loads also showed no differences between the two infections. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our results suggest that β-2 m and neopterin are useful tools for disease monitoring in both HIV-1 and HIV-2 infections, whereas sUPAR performed less well. Levels of immune activation per amount of virus were comparable in HIV-1 and HIV-2 infected subjects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».