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Enregistrement W2162198724 · doi:10.1242/jeb.01945

EXCITOTOXIC CELL DEATH DENIED

2005· article· en· W2162198724 sur OpenAlexaffabout
Jonathan A. W. Stecyk

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNMDA receptorPainted turtleNeuroscienceBiologyTurtle (robot)IntracellularExcitotoxicityGlutamate receptorProgrammed cell deathCell damageDepolarizationReceptorCell biologyEndocrinologyBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most vertebrates' brains die within minutes when deprived of molecular oxygen (anoxia), mainly due to excitotoxic cell death (ECD). ECD begins with a massive and uncontrolled influx of Ca2+ into neurons by over-stimulation of N-methyl-d-aspartate receptors(NMDARs), resulting in the activation of Ca2+-dependent phospholipases and proteases that cause membrane depolarisation, uncontrolled cellular swelling and, ultimately, cell death. Some ectothermic vertebrates,such as the western painted turtle (Chrysemys picta bellii), are remarkably anoxia tolerant and can survive days to months without oxygen and recover without any apparent brain damage. One mechanism that is believed to enable these animals to accomplish such a feat is their ability to prevent ECD by reducing NMDAR activity during anoxia. However, the mechanisms underlying the attenuation of turtle brain NMDAR activity have not been fully elucidated.Thomas Buck's team at the University of Toronto was determined to tease out how NMDAR activity is reduced in the turtle brain during anoxia. In order to do so, Buck's team obtained cortical slices from painted turtles' brains and used whole-cell patch clamp techniques to measure NMDAR currents from individual cortical neurons during normoxia and after 0, 20 and 40 min of anoxic exposure. As they expected, the team confirmed that turtle neuronal NMDAR activity is reduced during anoxia; during the 40-min anoxic period they observed a 56% decrease in whole-cell NMDAR currents from normoxic levels.To discover which intracellular modulators are responsible for this reduction of neuronal NMDAR activity, the team pharmacologically blocked possible modulators of NMDAR activity in the turtles' brains and again measured NMDAR currents from neurons in normoxic and anoxic experiments. Suspecting that protein phosphatases play a role, the team incubated the turtles' cortical slices in inhibitors of serine/threonine protein phosphatases PP1 and 2A and found they could abolish the anoxia-induced reduction in NMDAR currents. To test the role of intracellular Ca2+, they added the calcium chelator BAPTA to the recording electrode solution (which is continuous with the cytoplasm in whole-cell patch clamp experiments) and found that this also abolished the reduction in NMDAR currents. This indication that intracellular Ca2+ modulates NMDAR activity led the team to wonder about the role of calmodulin, an intermediary protein that senses calcium levels and relays signals to various calcium-sensitive enzymes, ion channels and other proteins. Sure enough, when the team pharmacologically blocked calmodulin during anoxia, they did not see a reduction in NMDAR current, indicating that calmodulin also controls NMDAR activity. The team concluded that protein phosphatases PP1 and 2A,intracellular Ca2+ and calmodulin all work in concert to decrease NMDAR activity during anoxia.Synthesizing their findings with previously published data, the team proposes a novel mechanism of how NMDAR activity is attenuated during anoxia. The team suggests that during anoxia, protein phosphatases PP1 and 2A dephosphorylate the NR1 subunit of the NMDAR receptor. Dephosphorylation of the NMDAR receptor subsequently enables calmodulin, which must first be activated by Ca2+, to bind to the receptor and disrupt NMDAR binding to α-actinin-2, a molecule that normally connects the NMDAR receptor to the cytoskeleton. Disruption of this connection results in the dissociation of the NMDAR from the cytoskeleton, ultimately leading to a decrease in receptor activity and prevention of ECD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission2
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