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Enregistrement W2162592055 · doi:10.1093/carcin/bgn030

Mgmt deficiency alters the in vivo mutational spectrum of tissues exposed to the tobacco carcinogen 4-(methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone (NNK)

2008· article· en· W2162592055 sur OpenAlexafffund
Linda E. Sandercock, Jennifer Hahn, Li Li, H. Artee Luchman, Jennette L. Giesbrecht, Lisa A. Peterson, Frank R. Jirik

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensAlberta Bone and Joint Health Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanada Research Chairs
Mots-clésCarcinogenMethyltransferaseDNA repairMutagenesisIn vivoCancer researchO-6-methylguanine-DNA methyltransferaseDNA damageDeoxyguanosineMutationDNA methyltransferaseChemistryDNA methylationBiologyMethylationMolecular biologyGeneticsDNAGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It has been proposed that O(6)-methylguanine DNA methyltransferase (MGMT) gene silencing in premalignant lesions and cancers of the lung might result in the acquisition of a 'mutator' phenotype. Previously, however, we found that Mgmt(-/-) mouse DNA failed to show an increase in spontaneous mutations. We thus hypothesized that only during exposure to specific environmental carcinogens would the consequences of MGMT deficiency become evident. Metabolism of the tobacco-derived nitrosamine, 4-(methylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanone (NNK) generates alkylating species that can react with the O(6) position of deoxyguanine, thereby yielding substrates for MGMT-mediated repair. To investigate how MGMT might regulate the mutational effects of NNK, Mgmt(-/-) mice were crossed with a lacI-based transgenic reporter line (Big Blue) thus enabling an assessment of the in vivo mutagenic effects of this agent. We observed the induction of a complex spectrum of NNK-dependent lacI mutations in both control and Mgmt(-/-) tissues, but only a trend in the mutant frequency increases that could be attributed to MGMT deficiency. The mutational spectra of NNK-treated Mgmt(-/-) lungs revealed an increase in the absolute number of G:C to A:T changes accompanied by a shift in these from CpG to GpG sites, consistent with an S(N)1 alkylation mechanism. In keeping with the high levels of MGMT expressed in the liver, more pronounced mutagenic effects and greater differences in O(6) position of deoxyguanosine adduct levels following NNK were observed in Mgmt(-/-) versus wild-type mice. Extrapolating to humans, MGMT-deficient cells would likely exhibit an increased mutational burden, but only following exposures to specific environmental mutagens such as NNK.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,658

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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