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Enregistrement W2162793198 · doi:10.1111/j.1529-8817.2010.00807.x

DNA BARCODING IS A POWERFUL TOOL TO UNCOVER ALGAL DIVERSITY: A CASE STUDY OF THE PHYLLOPHORACEAE (GIGARTINALES, RHODOPHYTA) IN THE CANADIAN FLORA

2010· article· en· W2162793198 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDNA barcodingGigartinalesEcologyContext (archaeology)Range (aeronautics)Genetic diversityBiodiversitySpecies complexUlvophyceaeZoologyAlgaePhylogenetic treeChlorophytaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have established that the 5′ end of the mitochondrial gene COI (cytochrome oxidase subunit I) is useful for rapid and reliable identification of red algal species and have demonstrated that our understanding of red algal biodiversity and biogeography is fragmentary. In this context, we are completing a thorough sampling along the Canadian coast and using the DNA barcode for the assignment of collections to genetic species to explore algal diversity in the Canadian flora. In the present study, we provide results regarding diversity of members of the red algal family Phyllophoraceae. We have analyzed 354 individuals from the Arctic, Atlantic, and Pacific coasts of Canada, as well as 26 specimens from the USA, Europe, and Australia, resolving 29 species based on the analyses of the DNA barcode. Twenty-three of these genetic species were present in Canada where only 18 species are currently recognized, including Ceratocolax hartzii Rosenv., which was in the same genetic species group as its host Coccotylus truncatus (Pall.) M. J. Wynne et N. J. Heine and is thus transferred to Coccotylus, C. hartzii (Rosenv.) comb. nov., but retained as a distinct species owing to its unique habit and phenology. Our results revealed the presence of cryptic diversity within the genera Coccotylus, Mastocarpus, Ozophora, and Stenogramme, for which we resurrect Coccotylus brodiei (Turner) Kütz. and describe Mastocarpus pachenicus sp. nov., Ozophora lanceolata sp. nov., and Stenogramme bamfieldiensis sp. nov., leaving a multitude of unnamed Mastocarpus spp. in need of further taxonomic study. In addition, we report range extensions into British Columbia of Besa papillaeformis Setch., previously known only from its type and nearby localities in California; Gymnogongrus crenulatus (Turner) J. Agardh, recorded only from the Atlantic; and Stenogramme cf. rhodymenioides Joly et Alveal, previously only known from South America. Finally, the phylogenetic affinities of the Canadian species of Phyllophoraceae characterized in this study were investigated using LSU rDNA, RUBISCO LSU (rbcL), and combined analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle