Structure and molecular evolution of the ribosomal DNA external transcribed spacer in the cockroach genus<i>Blattella</i>
Notice bibliographique
Résumé
The ribosomal DNA (rDNA) cluster of insects contains several hundred repeating structural-functional units and, therefore, is a typical example of a multigene family. Eukaryotic ribosomal RNA (rRNA) genes (18S, 5.8S, and 28S like) are arranged in tandemly repeated clusters in the nucleolus organizers, separated by several spacers, namely the nontranscribed spacer, the external transcribed spacer (ETS), and the internal transcribed spacers. The nucleotide sequences of the ETS of the three closely related Blattella cockroach species, Blattella germanica (Linnaeus, 1767), Blattella asahinai (Mizukubo, 1981), and Blattella lituricollis (Walker, 1868), were determined and compared. The three species had relatively similar ETS lengths, and sequence differences among them could be explained by two types of rearrangements, namely deletions of subrepeats and nucleotide substitutions. Minor ETS variants in B. germanica differed from the major variant in the same way that the major ETS variants of the three Blattella species differed from each other. Concerted evolution and the birth-and-death models, which are often invoked to explain the diversity and evolution of the multigene families of rDNA clusters, are discussed in the light of our data. A new model is proposed to explain the evolutionary reorganization of the ETS region: evolution of rDNA by "magnification-and-fixation" is characterized by magnification of minor subrepeats, which become adaptive in a new rapidly changed environment, and subsequent fixation of this variant type as a major component of the multigene family of a new species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».