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Enregistrement W2162914317 · doi:10.1136/jmg.40.4.e51

Absence of constitutional <i>H2AX</i> gene mutations in 101 hereditary breast cancer families

2003· article· en· W2162914317 sur OpenAlexaff
Álvaro N.A. Monteiro

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensCoalition for Research in Women's Health
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésCHEK2Breast cancerGermline mutationDNA repairCancer researchAtaxia-telangiectasiaCheckpoint Kinase 2GeneticsLi–Fraumeni syndromeDNA damageNonsense mutationGermlineBiologyMutationCancer syndromeCancerBRCA2 ProteinHomologous recombinationGeneDNAMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

everal genes involved in the DNA damage response and in maintaining genomic stability have emerged as breast cancer susceptibility genes.These include BRCA1 and BRCA2, as well as other genes with smaller contributions to breast cancer aetiology, such as TP53, CHEK2, and ATM.Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 increase sensitivity to DNA damage and decrease cellular capacity to repair double strand DNA breaks through homologous recombination.1-3 Interestingly, DNA damage induces activation of ATM (ataxia-telangiectasia mutated), which performs a central role in relaying signals that orchestrate DNA repair.4 People with heterozygous nonsense mutations in ATM appear to display increased susceptibility to breast cancer.5-7 Besides rapidly phosphorylating BRCA1, 8 activated ATM also phosphorylates p53 and CHEK2 (CHK2, hCDS1), which have been implicated in breast cancer predisposition.Germline mutations in TP53 or CHEK2 cause Li-Fraumeni syndrome, a multiple cancer phenotype syndrome, which features early onset breast cancer.9 10 Recently, it was found that germline mutations in CHEK2 also increase the relative risk for breast cancer outside the Li-Fraumeni syndrome.11 12 Given the emerging relationship of impaired DNA damage response and breast cancer susceptibility, we hypothesised that other genes in this pathway might be candidate cancer susceptibility genes.Histone H2AX (H2AFX, OMIM 601772) is such a candidate gene.H2AX is a minor variant of the highly conserved histone H2A that is part of the histone octamer in the core of the nucleosome.13 It differs from H2A by having a longer carboxyterminal tail that contains an SQE motif, a consensus site for phosphorylation by PI3K related kinases such as ATM, ATR, and DNA-PK.Following DNA damage, ATM phosphorylates H2AX at serine 139 (part of the SQE motif) 14 and phosphorylated H2AX (γ-H2AX) seems to localise specifically at sites of damage.15 16 More importantly, several proteins involved in DNA repair including BRCA1, BRCA2, Rad51, and Mre11 are recruited to sites of γ-H2AX.16 Two other independent lines of evidence derived from model organisms support the notion that H2AX plays an important role in the DNA damage response and in chromosomal stability.Phosphorylation of S129 of Saccharomyces cerevisiae H2A (homologous to S139 in human H2AX) is necessary for efficient processing of DNA repair and is proposed to cause alteration of chromatin structure that facilitates repair.17 Mice lacking H2AX are sensitive to radiation, are growth retarded, and their cells display high levels of ionising radiation induced chromosomal instability.18 19 Thus, although the exact function of H2AX is still unknown, it is clear that it plays a role in the DNA damage response.To establish if germline H2AX mutations are present in breast cancer families, DNA samples were obtained from 101 unrelated breast cancer patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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