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Enregistrement W2162931281 · doi:10.1074/jbc.m400518200

Structural Elements of Instantaneous and Slow Gating in Hyperpolarization-activated Cyclic Nucleotide-gated Channels

2004· article· en· W2162931281 sur OpenAlexafffund
Vincenzo Macri, Eric A. Accili

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesHarvard UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGatingHyperpolarization (physics)Cyclic nucleotideHCN channelBiophysicsChemistryCyclic gmpNucleotideIon channelBiologyBiochemistryStereochemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated (HCN) subunits produce a slowly activating current in response to hyperpolarization (If) and an instantaneous voltage-independent current (Iinst) when expressed in Chinese hamster ovary (CHO) cells. Here we found that a mutation in the S4-S5 linker of HCN2 (Y331D) produced an additional mixed cationic instantaneous current. However, this current was inhibited by external Cs+ like If and unlike Iinst. Together with a concomitant reduction in If, the data suggest that the Y331D mutation disrupted channel closing placing the channel in a "If-like," and not an "Iinst-like," state. The "If-like" instantaneous current represented approximately 70% of total If over voltages ranging from +20 to -150 mV in high K+ solutions. If activated at more depolarized potentials and the activation curve was less steep, whereas deactivation was significantly slowed, consistent with the idea that the mutation inhibited channel closing. The data suggest that the mutation produced allosteric effects on the activation gate (S6 segment) and/or on voltage-sensing elements. We also found that decreases in the ratio of external K+/Na+ further disrupted channel closing in the mutant channel. Finally, our data suggest that the structures involved in producing Iinst are similar between the HCN1 and HCN2 isoforms and that excess HCN protein on the plasma membrane of CHO cells relative to native cells is not responsible for Iinst. The data are consistent with Iinst flowing through a "leaky" closed state but do not rule out flow through a second configuration of recombinant HCN channels or up-regulated endogenous channels/subunits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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