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Enregistrement W2163147351 · doi:10.1186/1754-6834-6-139

Manipulating the sleeping beauty mutase operon for the production of 1-propanol in engineered Escherichia coli

2013· article· en· W2163147351 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiotechnology for Biofuels · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésOperonEscherichia coliBiochemistryMutaseBiologyGeneAlcohol dehydrogenaseMetabolic engineeringRecombineeringChemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: While most resources in biofuels were directed towards implementing bioethanol programs, 1-propanol has recently received attention as a promising alternative biofuel. Nevertheless, no microorganism has been identified as a natural 1-propanol producer. In this study, we manipulated a novel metabolic pathway for the synthesis of 1-propanol in the genetically tractable bacterium Escherichia coli. RESULTS: E. coli strains capable of producing heterologous 1-propanol were engineered by extending the dissimilation of succinate via propionyl-CoA. This was accomplished by expressing a selection of key genes, i.e. (1) three native genes in the sleeping beauty mutase (Sbm) operon, i.e. sbm-ygfD-ygfG from E. coli, (2) the genes encoding bifunctional aldehyde/alcohol dehydrogenases (ADHs) from several microbial sources, and (3) the sucCD gene encoding succinyl-CoA synthetase from E. coli. Using the developed whole-cell biocatalyst under anaerobic conditions, production titers up to 150 mg/L of 1-propanol were obtained. In addition, several genetic and chemical effects on the production of 1-propanol were investigated, indicating that certain host-gene deletions could abolish 1-propanol production as well as that the expression of a putative protein kinase (encoded by ygfD/argK) was crucial for 1-propanol biosynthesis. CONCLUSIONS: The study has provided a novel route for 1-propanol production in E. coli, which is subjected to further improvement by identifying limiting conversion steps, shifting major carbon flux to the productive pathway, and optimizing gene expression and culture conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle