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Enregistrement W2163255002 · doi:10.2174/1566524033479500

The Quest for a Tumor Suppressor Gene Phenotype

2003· review· en· W2163255002 sur OpenAlexaff
Nadège Presneau, Emily N. Manderson, Patricia N. Tonin

Notice bibliographique

RevueCurrent Molecular Medicine · 2003
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMontreal General HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeSuppressorGeneTumor suppressor geneCancer researchGeneticsBiologyComputational biologyCarcinogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our current definitions of the tumor suppressor gene (TSG) have been guided by the identification of the prototypical gene, RB1, a TSG that is implicated in the development of both the inherited and sporadic forms of retinoblastoma. The hallmark feature of this TSG is loss of function in tumoral cells, which can be restored by reintroduction of a normally functioning protein with concomitant reversion of tumorigenicity. Key to this discovery was that loss of function is often achieved by deletion of a normal copy of the TSG and retention of a mutated allele, which was either inherited or acquired. Suppression of tumorigenicity and the loss-of-function concept of TSGs was also demonstrated in early studies where normal cellular growth was achieved when tumorigenic cells were fused with normal cells. Thus loss of genetic content and restoration of gene function has guided studies aimed at the discovery of novel TSGs. Here we review the successes of TSG discovery using three approaches that are based on the genetic analysis of inherited predisposition to cancer, tumors that display chromosome loss, and tumorigenic cells that display a suppression of tumorigenicity as a result of transfer of normal chromosomes. Based on a review of the literature we conclude that the discovery of TSGs has been highly successful in the genetic analysis of inherited predisposition to cancer with a dominant mode of inheritance. In contrast, the latter two approaches have yielded a paucity of TSGs that exhibit features similar to the prototypical RB1 in that they are rarely inactivated by somatic mutations in tumors displaying LOH, although decreased gene expression is observed. Nevertheless, some of these genes have been shown to suppress tumorigenicity when normal function is restored in tumorigenic cells consistent with the loss-of-function concept. These observations continue to challenge our current definition of TSG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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