The Quest for a Tumor Suppressor Gene Phenotype
Notice bibliographique
Résumé
Our current definitions of the tumor suppressor gene (TSG) have been guided by the identification of the prototypical gene, RB1, a TSG that is implicated in the development of both the inherited and sporadic forms of retinoblastoma. The hallmark feature of this TSG is loss of function in tumoral cells, which can be restored by reintroduction of a normally functioning protein with concomitant reversion of tumorigenicity. Key to this discovery was that loss of function is often achieved by deletion of a normal copy of the TSG and retention of a mutated allele, which was either inherited or acquired. Suppression of tumorigenicity and the loss-of-function concept of TSGs was also demonstrated in early studies where normal cellular growth was achieved when tumorigenic cells were fused with normal cells. Thus loss of genetic content and restoration of gene function has guided studies aimed at the discovery of novel TSGs. Here we review the successes of TSG discovery using three approaches that are based on the genetic analysis of inherited predisposition to cancer, tumors that display chromosome loss, and tumorigenic cells that display a suppression of tumorigenicity as a result of transfer of normal chromosomes. Based on a review of the literature we conclude that the discovery of TSGs has been highly successful in the genetic analysis of inherited predisposition to cancer with a dominant mode of inheritance. In contrast, the latter two approaches have yielded a paucity of TSGs that exhibit features similar to the prototypical RB1 in that they are rarely inactivated by somatic mutations in tumors displaying LOH, although decreased gene expression is observed. Nevertheless, some of these genes have been shown to suppress tumorigenicity when normal function is restored in tumorigenic cells consistent with the loss-of-function concept. These observations continue to challenge our current definition of TSG.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».