Interactions between peptidoglycan and the ExeAB complex during assembly of the type II secretin of <i>Aeromonas hydrophila</i>
Notice bibliographique
Résumé
Aeromonas hydrophila transports extracellular protein toxins via the type II secretion system, an export mechanism comprised of numerous proteins that spans both the inner and outer membranes. Two components of this secretion system, ExeA and ExeB, form a complex in the inner membrane that functions to locate and/or assemble the ExeD secretin in the outer membrane. In the studies reported here, two-codon insertion mutagenesis of exeA revealed that an insertion at amino acid 495 in the C-terminal region of ExeA did not alter ExeAB complex formation yet completely abrogated its involvement in ExeD secretin assembly and thus rendered the bacteria secretion negative. In silico analysis of protein motifs with similar amino acid profiles revealed that this amino acid is located within a putative peptidoglycan (PG) binding motif in the periplasmic domain of ExeA. Substitution mutations of three highly conserved amino acids in the motif were constructed. In cells expressing each of these mutants, the ability to assemble the ExeD secretin or secrete aerolysin was lost, while ExeA retained the ability to form a complex with ExeB. In in vivo cross-linking experiments, wild-type ExeA could be cross-linked to PG, whereas the three substitution mutants of ExeA could not. These data indicate that PG binding and/or remodelling plays a role in the function of the ExeAB complex during assembly of the ExeD secretin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».