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Enregistrement W2163546813 · doi:10.1371/journal.pgen.1004679

Break-Induced Replication Requires DNA Damage-Induced Phosphorylation of Pif1 and Leads to Telomere Lengthening

2014· article· en· W2163546813 sur OpenAlexaff
Yulia Vasianovich, Lea Harrington, Svetlana Makovets

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensInstitute for Research in Immunology and CancerUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilDarwin Trust of EdinburghWellcome Trust
Mots-clésBiologyTelomereTelomeraseRAD51Replication protein ADNA damageG2-M DNA damage checkpointDNA replicationHomologous recombinationCell biologyDNA repairControl of chromosome duplicationRAD52Telomere-binding proteinReplication factor CMolecular biologyDNA ligaseDNAGeneticsCell cycleCell cycle checkpointDNA-binding proteinGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Broken replication forks result in DNA breaks that are normally repaired via homologous recombination or break induced replication (BIR). Mild insufficiency in the replicative ligase Cdc9 in budding yeast Saccharomyces cerevisiae resulted in a population of cells with persistent DNA damage, most likely due to broken replication forks, constitutive activation of the DNA damage checkpoint and longer telomeres. This telomere lengthening required functional telomerase, the core DNA damage signaling cascade Mec1-Rad9-Rad53, and the components of the BIR repair pathway - Rad51, Rad52, Pol32, and Pif1. The Mec1-Rad53 induced phosphorylation of Pif1, previously found necessary for inhibition of telomerase at double strand breaks, was also important for the role of Pif1 in BIR and telomere elongation in cdc9-1 cells. Two other mutants with impaired DNA replication, cdc44-5 and rrm3Δ, were similar to cdc9-1: their long telomere phenotype was dependent on the Pif1 phosphorylation locus. We propose a model whereby the passage of BIR forks through telomeres promotes telomerase activity and leads to telomere lengthening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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