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Enregistrement W2163808572 · doi:10.1186/1741-7007-9-31

PKC isoforms interact with and phosphorylate DNMT1

2011· article· en· W2163808572 sur OpenAlexaff
Geneviève Lavoie, Pierre‐Olivier Estève, Nathalie Bibens Laulan, Sriharsa Pradhan, Yves St‐Pierre

Notice bibliographique

RevueBMC Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein kinase CDNMT1PhosphorylationBiologyGene isoformDNA methylationMethylationHEK 293 cellsCell biologyMolecular biologyBiochemistryGene expressionDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: DNA methyltransferase 1 (DNMT1) has been shown to be phosphorylated on multiple serine and threonine residues, based on cell type and physiological conditions. Although recent studies have suggested that protein kinase C (PKC) may be involved, the individual contribution of PKC isoforms in their ability to phosphorylate DNMT1 remains unknown. The PKC family consists of at least 12 isoforms that possess distinct differences in structure, substrate requirement, expression and localization. RESULTS: Here we show that PKCα, βI, βII, δ, γ, η, ζ and μ preferentially phosphorylate the N-terminal domain of human DNMT1. No such phosphorylation of DNMT1 was observed with PKCε. Using PKCζ as a prototype model, we also found that PKC physically interacts with and phosphorylates DNMT1. In vitro phosphorylation assays conducted with recombinant fragments of DNMT1 showed that PKCζ preferentially phosphorylated the N-terminal region of DNMT1. The interaction of PKCζ with DNMT1 was confirmed by GST pull-down and co-immunoprecipitation experiments. Co-localization experiments by fluorescent microscopy further showed that endogenous PKCζ and DNMT1 were present in the same molecular complex. Endogenous PKCζ activity was also detected when DNMT1 was immunoprecipitated from HEK-293 cells. Overexpression of both PKCζ and DNMT1 in HEK-293 cells, but not of either alone, reduced the methylation status of genes distributed across the genome. Moreover, in vitro phosphorylation of DNMT1 by PKCζ reduced its methytransferase activity. CONCLUSIONS: Our results indicate that phosphorylation of human DNMT1 by PKC is isoform-specific and provides the first evidence of cooperation between PKCζ and DNMT1 in the control of the DNA methylation patterns of the genome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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