Molecular Genetic Analysis of an <i>SNF2</i> / <i>brahma</i> -Related Gene in <i>Tetrahymena thermophila</i> Suggests Roles in Growth and Nuclear Development
Notice bibliographique
Résumé
We used a reverse genetic approach to identify three members of the SNF2 superfamily of chromatin remodeling genes in the ciliated protozoan Tetrahymena thermophila in order to investigate possible functions of ATP-dependent chromatin remodeling factors in growth and nuclear development. Comparative sequence analysis of the gene product of the Tetrahymena brahma-related gene (TtBRG1) indicates it is a member of the SNF2/BRM subgroup of the SNF2 superfamily. Northern analysis suggests that TtBRG1 has roles in growth and nuclear development in Tetrahymena. Indirect immunofluorescence analysis during nuclear development indicates that TtBrg1p localizes to both the parental and developing macronucleus of Tetrahymena during the time period corresponding to genome rearrangements. We generated germ line knockout heterokaryons for TtBRG1 and demonstrated that expression of the gene is required to complete nuclear development of Tetrahymena. In addition, the formation of distinct Pdd1p-containing structures is disturbed during the late stages of conjugation in TtBRG1 germ line knockout heterokaryons. We discuss these results in light of possible roles of SNF2-related proteins in growth and nuclear development of Tetrahymena.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».