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Enregistrement W2164513579 · doi:10.1186/2040-2392-5-28

Recurrent duplications of the annexin A1 gene (ANXA1) in autism spectrum disorders

2014· article· en· W2164513579 sur OpenAlex
Catarina Correia, Inês C. Conceição, Bárbara Oliveira, Joana E. Coelho, Inês Sousa, Ana Filipa Sequeira, Joana Almeida, Cátia Café, Frederico Duque, Susana Mouga, Wendy Roberts, Kun Gao, Jennifer K. Lowe, Bhooma Thiruvahindrapuram, Susan Walker, Christian R. Marshall, Dalila Pinto, John I. Nürnberger, Stephen W. Scherer, Daniel H. Geschwind, Guiomar Oliveira, Astrid M. Vicente

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Autism · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensSickKids FoundationHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesJane and Terry Semel Institute for Neuroscience and Human Behavior, University of California, Los AngelesDavid Geffen School of Medicine, University of California, Los AngelesOntario Ministry of Research and InnovationMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenUniversidade de LisboaUniversity of TorontoUniversidade de CoimbraFondation de FranceMinistero della SaluteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAutism SpeaksSick Kids FoundationOntario Genomics InstituteNational Institutes of HealthOntario GenomicsFondation FondaMentalHussman FoundationHealth Research BoardWellcome TrustGenome CanadaChildren's Hospital of PhiladelphiaFondation OrangeNational Institute of Mental HealthFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of OttawaDeutsche ForschungsgemeinschaftOntario Innovation Trust
Mots-clésGene duplicationCopy-number variationGeneticsAutismAutism spectrum disorderCandidate geneBiologyBioinformaticsGeneMedicineGenomePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Validating the potential pathogenicity of copy number variants (CNVs) identified in genome-wide studies of autism spectrum disorders (ASD) requires detailed assessment of case/control frequencies, inheritance patterns, clinical correlations, and functional impact. Here, we characterize a small recurrent duplication in the annexin A1 (ANXA1) gene, identified by the Autism Genome Project (AGP) study. METHODS: From the AGP CNV genomic screen in 2,147 ASD individuals, we selected for characterization an ANXA1 gene duplication that was absent in 4,964 population-based controls. We further screened the duplication in a follow-up sample including 1,496 patients and 410 controls, and evaluated clinical correlations and family segregation. Sequencing of exonic/downstream ANXA1 regions was performed in 490 ASD patients for identification of additional variants. RESULTS: The ANXA1 duplication, overlapping the last four exons and 3'UTR region, had an overall prevalence of 11/3,643 (0.30%) in unrelated ASD patients but was not identified in 5,374 controls. Duplication carriers presented no distinctive clinical phenotype. Family analysis showed neuropsychiatric deficits and ASD traits in multiple relatives carrying the duplication, suggestive of a complex genetic inheritance. Sequencing of exonic regions and the 3'UTR identified 11 novel changes, but no obvious variants with clinical significance. CONCLUSIONS: We provide multilevel evidence for a role of ANXA1 in ASD etiology. Given its important role as mediator of glucocorticoid function in a wide variety of brain processes, including neuroprotection, apoptosis, and control of the neuroendocrine system, the results add ANXA1 to the growing list of rare candidate genetic etiological factors for ASD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,365
Score d'incertitude au seuil0,568

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle