Pir1p Mediates Translocation of the Yeast Apn1p Endonuclease into the Mitochondria To Maintain Genomic Stability
Notice bibliographique
Résumé
The mitochondrial genome is continuously subject to attack by reactive oxygen species generated through aerobic metabolism. This leads to the formation of a variety of highly genotoxic DNA lesions, including abasic sites. Yeast Apn1p is localized to the nucleus, where it functions to cleave abasic sites, and apn1 Delta mutants are hypersensitive to agents such as methyl methanesulfonate (MMS) that induce abasic sites. Here we demonstrate for the first time that yeast Apn1p is also localized to the mitochondria. We found that Pir1p, initially isolated as a cell wall constituent of unknown function, interacts with the C-terminal end of Apn1p, which bears a bipartite nuclear localization signal. Further analysis revealed that Pir1p is required to cause Apn1p mitochondrial localization, presumably by competing with the nuclear transport machinery. pir1 Delta mutants displayed a striking (approximately 3-fold) increase of Apn1p in the nucleus, which coincided with drastically reduced levels in the mitochondria. To explore the functional consequences of the Apn1p-Pir1p interaction, we measured the rate of mitochondrial mutations in the wild type and pir1 Delta and apn1 Delta mutants. pir1 Delta and apn1 Delta mutants exposed to MMS exhibited 3.6- and 5.8-fold increases, respectively, in the rate of mitochondrial mutations, underscoring the importance of Apn1p in repair of the mitochondrial genome. We conclude that Pir1p interacts with Apn1p, at the level of either the cytoplasm or nucleus, and facilitates Apn1p transport into the mitochondria to repair damaged DNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».