Concomitant high expression of Toll‐like receptor (TLR) and B‐cell receptor (BCR) signalling molecules has clinical implications in mantle cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mantle cell lymphoma (MCL) is an aggressive disease with frequent relapse. Targeted therapies against B‐cell receptor (BCR) molecules have demonstrated improved outcomes in relapsed cases. However, clinical responses are slow and selective, with failure to attain complete remission in a significant subset of patients. Complex interaction of BCR signal transduction with toll‐like receptor (TLR) and other pathways in MCL remains unknown, thus averting progress in development of targeted therapies. We have performed detailed digital quantification of BCR/TLR signalling molecules and their effector pathways in a cohort (n = 81) of MCL patients and correlated these data with overall survival. Hierarchical clustering model based on BCR/TLR genes revealed two distinct (BCRhigh and BCRlow) subsets of patients (n = 32; 40%) with significant differences in expression (>1.5‐fold change; p < 0.05). Higher levels of BTK/SYK/BLNK/CARD11/PLCG signalosome and lower expression of MALT1/BCL10 genes suggested tonic pattern of BCR activation. Amplified expression of TLR6/TLR7/TLR9 was noted in concert with hyper‐responsiveness of BCR machinery. MYD88, a key TLR adaptor molecule, was not upregulated in any of these clusters, which may suggest a ‘cross‐talk’ between BCR and TLR pathways. In sync with BCR/TLR signalling, we recorded significantly enhanced expression of genes associated with NF‐kB pathway in BCRhigh subset of MCL patients. On univariate analysis, the BCRhigh patients showed a trend towards inferior clinical response to a standardized treatment protocol, compared with the BCRlow group (log rank, p = 0.043). In conclusion, we have identified hyperactive BCR/TLR signalling pathways and their effector downstream targets in a subset of MCL patients and associated it with poor clinical outcomes. Our study provides quantitative evidence at RNA expression level of possible concomitant collaboration between TLR and BCR signalling molecules in MCL. These data will provide further insights for future functional studies and, hence, development of targeted therapies for MCL patients. Copyright © 2015 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».