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Enregistrement W2164571519 · doi:10.1002/hon.2251

Concomitant high expression of Toll‐like receptor (TLR) and B‐cell receptor (BCR) signalling molecules has clinical implications in mantle cell lymphoma

2015· article· en· W2164571519 sur OpenAlexafffund
Ariz Akhter, Lesley Street, Sunita Ghosh, Bruce F. Burns, Ghaleb Elyamany, Meer‐Taher Shabani‐Rad, Douglas A. Stewart, Adnan Mansoor

Notice bibliographique

RevueHematological Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of OttawaCalgary Laboratory ServicesUniversity of AlbertaAlberta Cancer FoundationUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAlberta Cancer FoundationCalgary Laboratory Services
Mots-clésbreakpoint cluster regionCancer researchSykBiologyB-cell receptorMantle cell lymphomaToll-like receptorSignal transductionTLR7Bruton's tyrosine kinaseTLR9ReceptorImmunologyB cellGene expressionCell biologyInnate immune systemImmune systemGeneLymphomaGeneticsTyrosine kinaseAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mantle cell lymphoma (MCL) is an aggressive disease with frequent relapse. Targeted therapies against B‐cell receptor (BCR) molecules have demonstrated improved outcomes in relapsed cases. However, clinical responses are slow and selective, with failure to attain complete remission in a significant subset of patients. Complex interaction of BCR signal transduction with toll‐like receptor (TLR) and other pathways in MCL remains unknown, thus averting progress in development of targeted therapies. We have performed detailed digital quantification of BCR/TLR signalling molecules and their effector pathways in a cohort ( n = 81) of MCL patients and correlated these data with overall survival. Hierarchical clustering model based on BCR/TLR genes revealed two distinct (BCR high and BCR low ) subsets of patients ( n = 32; 40%) with significant differences in expression (>1.5‐fold change; p < 0.05). Higher levels of BTK / SYK / BLNK / CARD11 / PLCG signalosome and lower expression of MALT1 / BCL10 genes suggested tonic pattern of BCR activation. Amplified expression of TLR6 / TLR7 / TLR9 was noted in concert with hyper‐responsiveness of BCR machinery. MYD88 , a key TLR adaptor molecule, was not upregulated in any of these clusters, which may suggest a ‘cross‐talk’ between BCR and TLR pathways. In sync with BCR/TLR signalling, we recorded significantly enhanced expression of genes associated with NF‐kB pathway in BCR high subset of MCL patients. On univariate analysis, the BCR high patients showed a trend towards inferior clinical response to a standardized treatment protocol, compared with the BCR low group ( log rank , p = 0.043). In conclusion, we have identified hyperactive BCR/TLR signalling pathways and their effector downstream targets in a subset of MCL patients and associated it with poor clinical outcomes. Our study provides quantitative evidence at RNA expression level of possible concomitant collaboration between TLR and BCR signalling molecules in MCL. These data will provide further insights for future functional studies and, hence, development of targeted therapies for MCL patients. Copyright © 2015 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,557
Score d'incertitude au seuil0,690

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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