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Enregistrement W2164572104 · doi:10.1136/jclinpath-2012-201417

T-cell clonality is detected in a high frequency among patients with incidental lymphocytosis by PCR assays for <i>TCR</i> gene rearrangements

2013· article· en· W2164572104 sur OpenAlexaff
Fenglin Cao, Shuye Wang, Hui Zhao, Jin Zhou, Guisheng Yang, Chen Wang

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLymphocytosisImmunophenotypingT-cell receptorGene rearrangementBiologyImmunologyCD8Molecular biologyPathologyT cellVirologyMedicineAntigenGeneGeneticsImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Clonal expansion of lymphocytes may account for asymptomatic lymphocytosis. Unlike monoclonal B lymphocytosis, the detection of T-cell clones is difficult using immunophenotype-based assays. This study aimed to evaluate PCR-based clonality assays for the identification of T-cell clones among patients with unexplained lymphocytosis. METHODS: We incorporated the BIOMED-2 multiplex PCR into the investigation of peripheral lymphocytosis. Clonality analysis was performed with three reactions for TCRβ and two reactions for TCRγ gene rearrangements. The analysis was performed with blood specimens from a total of 150 adult patients who presented with incidental lymphocytosis. RESULTS: PCR assays were validated using confirmed T-cell malignancies and the detection sensitivity was determined at a level of 2%. Using the TCRβ and TCRγ combination, 25 (16.6%) of 150 patients were found to have clonal TCR arrangement. Patients who harboured clonal T cells presented with a mild to moderate absolute lymphocytosis, with a median lymphocyte count of 4.5 × 10(9)/l (range 3.7-9.8 × 10(9)) and the absence of other haematological abnormalities. Immunophenotyping confirmed T-cell lymphocytosis with an increase in CD8 T cells in the majority of patients. CONCLUSIONS: This study demonstrated the use of PCR assays for the effective detection of clonal T lymphocytosis. Our data indicate a high prevalence of silent T-cell clones among patients with peripheral lymphocytosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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