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Enregistrement W2164642954 · doi:10.1002/ajmg.a.20495

The hedgehog signaling network

2003· review· en· W2164642954 sur OpenAlexaff
M. Michael Cohen

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2003
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPatchedSmoothenedHedgehogBiologyCell biologyHedgehog signaling pathwayTransmembrane proteinSignal transductionBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the hedgehog signaling network, mutations result in various phenotypes, including, among others, holoprosencephaly, nevoid basal cell carcinoma syndrome, Pallister-Hall syndrome, Greig cephalopolysyndactyly, Rubinstein-Taybi syndrome, isolated basal cell carcinoma, and medulloblastoma. Active Hedgehog ligand is double lipid modified with a C-terminal cholesterol moiety and an N-terminal palmitate. Transport active Hedgehog from the signaling cell to the responding cell occurs through three mechanisms: 1). formation of multimeric Hedgehog which makes it soluble; 2). function of Dispatched in releasing the lipid-anchored protein from the signaling cell; and 3). movement across the plasma membrane of the responding cell by Tout-velu-dependent synthesis of heparan sulfate proteoglycan. In the responding cell, active Hedgehog binds to its receptor Patched, a 12-pass transmembrane protein, which frees Smoothened, an adjacent 7-pass transmembrane protein, for downstream signaling. Patched and Smoothened may shuttle oppositely between the plasma membrane and endocytic vesicles in response to active Hedgehog ligand. In downstream signaling, Cubitus interruptus (Gli proteins in vertebrates), Costal 2, Fused, and Suppressor of Fused form a tetrameric complex. Cubitus interruptus is a bifunctional transcription regulator. In the absence of active Hedgehog ligand, a truncated transcriptional repressor is generated that binds target genes and blocks their transcription. In the presence of active Hedgehog ligand, a full length transcriptional activator binds target genes and upregulates their transcription. Target genes include Wingless (Wnt gene family in vertebrates), Decapentaplegic (Bone Morphogenetic Proteins in vertebrates), and Patched. The upregulation of Patched expression, resulting in Patched protein at the cell membrane, sequesters Hedgehog and limits its spread beyond the cells in which it is produced. Thus, a balance is created by the antagonism of Hedgehog and Patched, whose relative concentrations alternate with respect to each other. Many more factors that are essential for the hedgehog signaling network are also discussed: Megalin, Rab23, Hip, GAS1, PKA, GSK3, CK1, Slimb, SAP18, and CBP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,078

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0230,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations413
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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