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Enregistrement W2164738046 · doi:10.1371/journal.pone.0051314

mMaple: A Photoconvertible Fluorescent Protein for Use in Multiple Imaging Modalities

2012· article· en· W2164738046 sur OpenAlexafffund
Ann McEvoy, Hiofan Hoi, Mark Bates, Evgenia Platonova, Paula J. Cranfill, Michelle A. Baird, Michael W. Davidson, Helge Ewers, Jan Liphardt, Robert E. Campbell

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOffice of ScienceHolcim Stiftung zur Förderung der Wissenschaftlichen FortbildungÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneU.S. Department of EnergyEuropean Molecular Biology OrganizationNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMicroscopyConfocal microscopyFluorescence microscopeFörster resonance energy transferFluorescenceFluorescence-lifetime imaging microscopyFluorescent proteinConfocalResolution (logic)Yellow fluorescent proteinBiophysicsLive cell imagingGreen fluorescent proteinEscherichia coliCell biologyChemistryBiologyCellOpticsComputer scienceBiochemistryPhysicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in fluorescence microscopy have extended the spatial resolution to the nanometer scale. Here, we report an engineered photoconvertible fluorescent protein (pcFP) variant, designated as mMaple, that is suited for use in multiple conventional and super-resolution imaging modalities, specifically, widefield and confocal microscopy, structured illumination microscopy (SIM), and single-molecule localization microscopy. We demonstrate the versatility of mMaple by obtaining super-resolution images of protein organization in Escherichia coli and conventional fluorescence images of mammalian cells. Beneficial features of mMaple include high photostability of the green state when expressed in mammalian cells and high steady state intracellular protein concentration of functional protein when expressed in E. coli. mMaple thus enables both fast live-cell ensemble imaging and high precision single molecule localization for a single pcFP-containing construct.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations154
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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