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Enregistrement W2164756176 · doi:10.1016/j.pbiomolbio.2011.07.001

Minimum Information about a Cardiac Electrophysiology Experiment (MICEE): Standardised reporting for model reproducibility, interoperability, and data sharing

2011· review· en· W2164756176 sur OpenAlexaff
T. Alexander Quinn, Stephen J. Granite, Maurits A. Allessie, Charles Antzelevitch, Christian Bollensdorff, Gil Bub, Rebecca A.B. Burton, Elisabetta Cerbai, Pisin Chen, Mario Delmar, Dario DiFrancesco, Y.E. Earm, Igor R. Efimov, M. Egger, Emilia Entcheva, Martin Fink, Rodolphe Fischmeister, Michael R. Franz, Alan Garny, Wayne R. Giles, Tobias Hannes, Siân E. Harding, Peter Hunter, Gentaro Iribe, José Jalife, Chris R. Johnson, Robert S. Kass, Itsuo Kodama, Gideon Koren, Phillip Lord, Markhasin Vs, Satoshi Matsuoka, Andrew D. McCulloch, Gary R. Mirams, Glenn Morley, Stanley Nattel, Denis Noble, Søren‐Peter Olesen, Alexander V. Panfilov, Natalia A. Trayanova, Ursula Ravens, Sylvain Richard, David Rosenbaum, Yoram Rudy, Frederick Sachs, Frank B. Sachse, David A. Saint, Ulrich Schotten, Olga Solovyova, Peter Taggart, L. Tung, András Varró, Paul G.A. Volders, Ken Wang, James N. Weiss, E. Wettwer, Ed White, Ronald Wilders, R.L. Winslow, Peter Köhl

Notice bibliographique

RevueProgress in Biophysics and Molecular Biology · 2011
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institutes of HealthEuropean CommissionBritish Heart Foundation
Mots-clésInteroperabilityCardiac electrophysiologyComputer scienceElectrophysiologyChannel (broadcasting)PsychologyNeuroscienceWorld Wide WebTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiac experimental electrophysiology is in need of a well-defined Minimum Information Standard for recording, annotating, and reporting experimental data. As a step towards establishing this, we present a draft standard, called Minimum Information about a Cardiac Electrophysiology Experiment (MICEE). The ultimate goal is to develop a useful tool for cardiac electrophysiologists which facilitates and improves dissemination of the minimum information necessary for reproduction of cardiac electrophysiology research, allowing for easier comparison and utilisation of findings by others. It is hoped that this will enhance the integration of individual results into experimental, computational, and conceptual models. In its present form, this draft is intended for assessment and development by the research community. We invite the reader to join this effort, and, if deemed productive, implement the Minimum Information about a Cardiac Electrophysiology Experiment standard in their own work.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,136
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,129
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,864
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1360,129
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,003
Bibliométrie0,0080,005
Études des sciences et des technologies0,0020,006
Communication savante0,0060,008
Science ouverte0,0080,006
Intégrité de la recherche0,0060,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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