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Enregistrement W2165076482 · doi:10.1136/sti.2008.031815

Herpes simplex virus type 2 antibody detection performance in Kisumu, Kenya, using the Herpeselect ELISA, Kalon ELISA, Western blot and inhibition testing

2008· article· en· W2165076482 sur OpenAlexaff
Jennifer S. Smith, Robin L. Bailey, Daniel Westreich, Ian Maclean, Kawango Agot, J. Ndinya-Achola, Wayne Hogrefe, Rhoda Ashley Morrow, Stephen Moses

Notice bibliographique

RevueSexually Transmitted Infections · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésWestern blotHerpes simplex virusAntibodyVirologySeroprevalenceMedicineRecombinant DNAVirusMolecular biologyBiologyImmunologySerology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In certain parts of Africa, type-specific herpes simplex virus type 2 (HSV-2) ELISAs may have limited specificity. To date, no study has been conducted to validate HerpeSelect and Kalon type-specific HSV-2 ELISAs using both the Western blot and recombinant gG ELISA inhibition testing as reference standards. METHODS: A total of 120 men who were HIV seronegative (aged 18-24 years) provided blood samples. HSV-2 IgG serum antibodies were detected using four different methods: HerpeSelect HSV-2 ELISA (n = 120), Kalon HSV-2 ELISA (n = 120), University of Washington Western blot (n = 101) and a recombinant inhibition test (n = 93). RESULTS: HSV-2 seroprevalence differed significantly by HSV-2 detection method, ranging from 24.8% with the Western blot to 69.8% with the HerpeSelect ELISA. Using the Western blot as the reference standard, the HerpesSelect had the highest sensitivity for HSV-2 antibody detection (100%) yet lowest specificity (40%). Similar results were obtained using the inhibition test as the reference standard. The sensitivity and specificity of the Kalon test versus the Western blot were 92% and 79%, respectively, and 80% and 82% versus the inhibition test. Using the inhibition test as the reference standard, the sensitivity of the Western blot appeared low (49%). CONCLUSIONS: In men in western Kenya who were HIV seronegative, the HerpeSelect and Kalon type-specific ELISAs had high sensitivities yet limited specificities using the Western blot as reference standard. Overall, the Kalon ELISA performed better than the HerpeSelect ELISA in these young men from Kisumu. Further understanding is needed for the interpretation of HSV-2 inhibition or ELISA test positive/ Western blot seronegative results. Before HSV-2 seropositivity may be reliably reported in selected areas of Africa, performance studies of HSV-2 serological assays in individual geographical areas are recommended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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