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Enregistrement W2165286507 · doi:10.1002/poc.1269

Acid catalyzed intramolecular attack of <i>β</i>‐phenylthioureido group on amide function. Parallel formation of thiodihydrouracil and 4‐iminothiodihydrouracil. Different pathways in the Edman degradation reaction in the formation of six‐ <i>versus</i> five‐membered cyclic intermediates

2007· article· en· W2165286507 sur OpenAlexfundno aff
Ivan G. Pojarlieff, Iva B. Blagoeva, Maria M. Toteva, Ergun Atay, Violina T. Angelova, Nikolay Vassilev, Asen H. Koedjikov

Notice bibliographique

RevueJournal of Physical Organic Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcGill UniversityNational Science Foundation
Mots-clésChemistryAmideProtonationReaction rate constantImineIntramolecular forceMedicinal chemistryHydrolysisCyclopentaneStereochemistryRing strainTetrahedral carbonyl addition compoundCatalysisRing (chemistry)NucleophileOrganic chemistryKinetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Contrary to the cleavage of α ‐phenylthioureido peptides 1 proceeding through intermediate 2‐anilinothiazolinone 2 , the b‐analog cis ‐2‐(3‐phenylthioureido)cyclopentane‐carboxamide 5 forms transiently 4‐imino‐2‐thioxopyrimidine 6 . Monitoring amide cyclization and hydrolysis of iminopyrimidine 6 in acid by UV showed that an equilibrium between 5 and 6 was reached followed by slower conversion of both compounds into 2‐oxo‐4‐thioxopyrimidine 7 . Both processes were characterized by isosbestic points, the first due to parallel conversion of 5 into 6 and 7 (or 6 into 5 and 7 ) at a constant ratio while the second identical for both reactants – to conversion of equilibrated 5 and 6 into 7 . The special isosbestic points allowed the determination of the individual constants of Scheme 2. Further confirmation was obtained from NMR product analysis and following the cyclization of amide 5 in DMSO:DCl. Product 2‐oxo‐4‐ thioxopyrimidine 7 hydrolyzed reversibly to thioureido acid 8 . The cyclization rate of 8 allowed the participation of 6‐oxothiazine 10 formed by sulfur attack to be excluded. The absence of sulfur attack in the six‐membered case is explained by the longer CS bond bringing about greater bond angle strain at the tetrahedral ring atoms due to the geometrical characteristics of five‐ and six‐membered rings with planar segments. The cyclizations of amide 5 to iminopyrimidine 6 and to thiodihydrouracil 7 are first order in [H + ], while the reactions of protonated imine 6 H + are zero order to amide and −1 to thiodihydrouracil. The reaction orders can be reconciled by assuming a rate determining proton transfer from the tetrahedral intermediate in amide cyclization. Copyright © 2007 John Wiley &amp; Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,494

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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