Ablation of the Complementarity-Determining Region H3 Apex of the Anti-HIV-1 Broadly Neutralizing Antibody 2F5 Abrogates Neutralizing Capacity without Affecting Core Epitope Binding
Notice bibliographique
Résumé
The identification and characterization of broadly neutralizing antibodies (bnAbs) against HIV-1 has formed a major research focus, with the ultimate goal to help in the design of an effective AIDS vaccine. One of these bnAbs, 2F5, has been extensively characterized, and residues at the apex of its unusually long complementarity-determining region (CDR) H3 loop have been shown to be crucial for neutralization. Structural studies, however, have revealed that the (100)TLFGVPI(100F) apex residues of the CDR H3 loop do not interact directly with residues of its core gp41 epitope. In an attempt to gain better insight into the functional role of this element, we have recombinantly expressed native 2F5 Fab and two mutants in which either the apical Phe100B(H) residue was changed to an alanine or the CDR H3 residues (100)TLFGVPI(100F) were replaced by a Ser-Gly dipeptide linker. Isothermal titration calorimetry (ITC) and competitive-binding enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) rendered strikingly similar affinity constants (K(d) [dissociation constant] of approximately 20 nM) for linear peptide epitope binding by 2F5 Fabs, independent of the presence or absence of the apex residues. Ablation of the CDR H3 apex residues, however, abolished the cell-cell fusion inhibition and pseudovirus neutralization capacities of 2F5 Fab. We report competitive ELISA data that suggest a role of 2F5 CDR H3 apex residues in mediating weak hydrophobic interactions with residues located at the C terminus of the gp41 membrane proximal external region and/or membrane components in the context of core epitope binding. The present data therefore imply an extended 2F5 paratope that includes weak secondary interactions that are crucial for neutralization of Env-mediated fusion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».