Molecular polymorphism and virulence phenotypes of the wheat leaf rust fungus <i>Puccinia triticina</i> in Canada
Notice bibliographique
Résumé
Sixty-nine Puccinia triticina isolates from the eastern region of Ontario and Quebec, the prairie region of Manitoba and Saskatchewan, and Alberta were tested for virulence to 22 near-isogenic Thatcher wheat lines in seedling tests and the Thatcher line with Lr22b in adult plant tests. The isolates were also tested for amplified fragment length polymorphism (AFLP) using 10 specific amplification primer pairs. Thirty-seven distinct virulence phenotypes were identified using the Thatcher lines and 69 molecular phenotypes were identified with 164 AFLP markers. The correlation of isolate grouping based on virulence phenotypes and AFLP phenotypes was 0.53. Almost all isolates from Manitoba and Saskatchewan with virulence to Lr17 had AFLP phenotypes that differed significantly from isolates in the same region that were avirulent to Lr17. This indicated that isolates with virulence to Lr17 are most likely a recent introduction to the prairie region. The presence of distinct groups of isolates based on virulence and AFLP variation provides evidence that a number of different P. triticina phenotypes have been introduced to North America.Key words: Puccinia recondita f.sp. tritici, AFLP, specific virulence.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».