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Enregistrement W2166600125 · doi:10.1085/jgp.200308842

Conotoxins as Sensors of Local pH and Electrostatic Potential in the Outer Vestibule of the Sodium Channel

2003· article· en· W2166600125 sur OpenAlexafffund
Kwokyin Hui, Deane D. McIntyre, Robert J. French

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche MédicaleMcMaster UniversityUniversity of Calgary
Mots-clésChemistryBatrachotoxinSodium channelTitrationBiophysicsConductanceTitration curveHistidineSodiumStereochemistryAmino acidBiochemistryInorganic chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We examined the block of voltage-dependent rat skeletal muscle sodium channels by derivatives of mu-conotoxin GIIIA (muCTX) having either histidine, glutamate, or alanine residues substituted for arginine-13. Toxin binding and dissociation were observed as current fluctuations from single, batrachotoxin-treated sodium channels in planar lipid bilayers. R13X derivatives of muCTX only partially block the single-channel current, enabling us to directly monitor properties of both muCTX-bound and -unbound states under different conditions. The fractional residual current through the bound channel changes with pH according to a single-site titration curve for toxin derivatives R13E and R13H, reflecting the effect of changing the charge on residue 13, in the bound state. Experiments with R13A provided a control reflecting the effects of titration of all residues on toxin and channel other than toxin residue 13. The apparent pKs for the titration of residual conductance are shifted 2-3 pH units positive from the nominal pK values for histidine and glutamate, respectively, and from the values for these specific residues, determined in the toxin molecule in free solution by NMR measurements. Toxin affinity also changes dramatically as a function of pH, almost entirely due to changes in the association rate constant, kon. Interpreted electrostatically, our results suggest that, even in the presence of the bound cationic toxin, the channel vestibule strongly favors cation entry with an equivalent local electrostatic potential more negative than -100 mV at the level of the "outer charged ring" formed by channel residues E403, E758, D1241, and D1532. Association rates are apparently limited at a transition state where the pK of toxin residue 13 is closer to the solution value than in the bound state. The action of these unique peptides can thus be used to sense the local environment in the ligand--receptor complex during individual molecular transitions and defined conformational states.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,137

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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