Regulation of gene expression in mouse macrophages stimulated with bacterial CpG-DNA and lipopolysaccharide
Notice bibliographique
Résumé
CpG-DNA is known as a potent immunostimulating agent and may contribute in therapeutic treatment of many immune disorders. CpG-DNA triggers innate and acquired immune responses through activated expression of various genes in immune cells, including macrophages. To define the molecular mechanism(s) by which CpG-DNA activates immune cells, we studied macrophage gene expression following CpG-DNA exposure using high-density oligonucleotide microarrays. As CpG-DNA receptor Toll-like receptor 9 (TLR9) shares homology with the lipopolysaccharide (LPS)-TLR4 receptor, we compared gene expression profiles in macrophages stimulated by LPS versus CpG-DNA. CpG-DNA and LPS modulate expression of many genes encoding cytokines, cell surface receptors, transcription factors, and proteins related to cell proliferation/differentiation. However, LPS modulated expression of significantly more genes than did CpG-DNA, and all genes induced or repressed by CpG-DNA were induced or repressed by LPS. We conclude that CpG-DNA signaling through TLR9 activates a subset of genes induced by LPS-TLR4 signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».