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Enregistrement W2167283992 · doi:10.1093/jac/dkq133

Identification of a blaVIM-4 gene in the internationally successful Klebsiella pneumoniae ST11 clone and in a Klebsiella oxytoca strain in Hungary

2010· letter· en· W2167283992 sur OpenAlexaboutno aff
Katalin Kristóf, Ákos Tóth, Ivelina Damjanova, Laura Jánvári, Marianne Konkoly-Thege, Béla Kocsis, R. Koncan, Giuseppe Cornaglia, Eszter Szegő, K. Nagy, Dóra Szabó

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2010
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliclone (Java method)Klebsiella pneumoniaeMicrobiologyMultilocus sequence typingBiologyKlebsiella oxytocaVirulenceGeneGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sir, The VIM-type metallo-β-lactamases (MBLs) have been detected worldwide in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp., and, more recently, in many species of Enterobacteriaceae. After the first detection of VIM-4 in P. aeruginosa in Greece in 2001,1 these strains were isolated in many countries, including Hungary, where VIM-4- producing P. aeruginosa and Aeromonas hydrophila were reported.2,3 In Hungarian clinical microbiological laboratories, the screening for presumptive carbapenemase producers is performed according to Hungarian guidelines, which are based on the CLSI recommendations.4 The putative production of MBLs is tested by the modified Hodge test, and disc tests containing imipenem and/or ceftazidime either alone or combined with EDTA. In 2009, 5% of Klebsiella spp. (1.4% of Enterobacteriaceae) isolates from the BP1 centre and 4.76% of Klebsiella spp. (2.4% of Enterobacteriaceae) isolates from the BP2 centre were ertapenem-resistant non-carbapenemase producers. No imipenem or meropenem non-susceptible strains were isolated during this year. Based on screening and confirmatory tests, one carbapenem-susceptible Klebsiella pneumoniae strain (KP3686) isolated from bronchoalveolar lavage (BP1 centre, February 2009) and one carbapenem-susceptible Klebsiella oxytoca strain (KO5294/9) isolated from stool (BP2 centre, July 2009) proved to be MBL producers. The aim of our study was to characterize the first Hungarian MBL-producing K. pneumoniae KP3686 and K. oxytoca KO5294/9 isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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