Simultaneous profiling of seed‐associated bacteria and fungi reveals antagonistic interactions between microorganisms within a shared epiphytic microbiome on <i><scp>T</scp>riticum</i> and <i><scp>B</scp>rassica</i> seeds
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
In order to address the hypothesis that seeds from ecologically and geographically diverse plants harbor characteristic epiphytic microbiota, we characterized the bacterial and fungal microbiota associated with Triticum and Brassica seed surfaces. The total microbial complement was determined by amplification and sequencing of a fragment of chaperonin 60 (cpn60). Specific microorganisms were quantified by qPCR. Bacteria and fungi corresponding to operational taxonomic units (OTU) that were identified in the sequencing study were isolated and their interactions examined. A total of 5477 OTU were observed from seed washes. Neither total epiphytic bacterial load nor community richness/evenness was significantly different between the seed types; 578 OTU were shared among all samples at a variety of abundances. Hierarchical clustering revealed that 203 were significantly different in abundance on Triticum seeds compared with Brassica. Microorganisms isolated from seeds showed 99-100% identity between the cpn60 sequences of the isolates and the OTU sequences from this shared microbiome. Bacterial strains identified as Pantoea agglomerans had antagonistic properties toward one of the fungal isolates (Alternaria sp.), providing a possible explanation for their reciprocal abundances on both Triticum and Brassica seeds. cpn60 enabled the simultaneous profiling of bacterial and fungal microbiota and revealed a core seed-associated microbiota shared between diverse plant genera.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle