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Enregistrement W2167395503 · doi:10.1161/circresaha.113.301302

Quaking, an RNA-Binding Protein, Is a Critical Regulator of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype

2013· article· en· W2167395503 sur OpenAlexaff
Eric P. van der Veer, Ruben G. de Bruin, Adriaan O. Kraaijeveld, Margreet R. de Vries, Ilze Bot, Tonio Pera, Filip M. Segers, Stella Trompet, Janine M. van Gils, Marko K. Roeten, Cora Beckers, Peter J. van Santbrink, Anique Janssen, Coen van Solingen, Jim Swildens, Hetty C. de Boer, Erna A Peters, Roel Bijkerk, Mat Rousch, Merijn Doop, Johan Kuiper, Martin J. Schalij, Allard C. van der Wal, Stéphane Richard, Theo J.C. van Berkel, J. Geoffrey Pickering, Pieter S. Hiemstra, Marie‐José Goumans, Ton J. Rabelink, Antoine A.F. de Vries, Paul H.A. Quax, J. Wouter Jukema, Erik A.L. Biessen, Anton Jan van Zonneveld

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyocardinVascular smooth muscleBiologyRNA-binding proteinCell biologyNeointimaRNA splicingAlternative splicingSpliceosomeGene knockdownMessenger RNAExonSerum response factorRegulatorRNASplicing factorCancer researchTranscription factorInternal medicineEndocrinologyGeneGeneticsRestenosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: RNA-binding proteins are critical post-transcriptional regulators of RNA and can influence pre-mRNA splicing, RNA localization, and stability. The RNA-binding protein Quaking (QKI) is essential for embryonic blood vessel development. However, the role of QKI in the adult vasculature, and in particular in vascular smooth muscle cells (VSMCs), is currently unknown. OBJECTIVE: We sought to determine the role of QKI in regulating adult VSMC function and plasticity. METHODS AND RESULTS: We identified that QKI is highly expressed by neointimal VSMCs of human coronary restenotic lesions, but not in healthy vessels. In a mouse model of vascular injury, we observed reduced neointima hyperplasia in Quaking viable mice, which have decreased QKI expression. Concordantly, abrogation of QKI attenuated fibroproliferative properties of VSMCs, while potently inducing contractile apparatus protein expression, rendering noncontractile VSMCs with the capacity to contract. We identified that QKI localizes to the spliceosome, where it interacts with the myocardin pre-mRNA and regulates the splicing of alternative exon 2a. This post-transcriptional event impacts the Myocd_v3/Myocd_v1 mRNA balance and can be modulated by mutating the quaking response element in exon 2a of myocardin. Furthermore, we identified that arterial damage triggers myocardin alternative splicing and is tightly coupled with changes in the expression levels of distinct QKI isoforms. CONCLUSIONS: We propose that QKI is a central regulator of VSMC phenotypic plasticity and that intervention in QKI activity can ameliorate pathogenic, fibroproliferative responses to vascular injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations122
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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