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Escherichia coli K-12: a cooperatively developed annotation snapshot--2005

2006· article· en· 625 citations· W2167708455 sur OpenAlex· 10.1093/nar/gkj405

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants
0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

The goal of this group project has been to coordinate and bring up-to-date information on all genes of Escherichia coli K-12. Annotation of the genome of an organism entails identification of genes, the boundaries of genes in terms of precise start and end sites, and description of the gene products. Known and predicted functions were assigned to each gene product on the basis of experimental evidence or sequence analysis. Since both kinds of evidence are constantly expanding, no annotation is complete at any moment in time. This is a snapshot analysis based on the most recent genome sequences of two E.coli K-12 bacteria. An accurate and up-to-date description of E.coli K-12 genes is of particular importance to the scientific community because experimentally determined properties of its gene products provide fundamental information for annotation of innumerable genes of other organisms. Availability of the complete genome sequence of two K-12 strains allows comparison of their genotypes and mutant status of alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nucleic Acids Research
Thématique
Bacterial Genetics and Biotechnology
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
Core Research for Evolutional Science and TechnologyNational Institute of General Medical SciencesDirectorate for Biological SciencesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyUniversity of OxfordWellcome TrustGenome CanadaPurdue UniversityU.S. Department of EnergyNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clés
BiologyGenomeGeneAnnotationGeneticsEscherichia coliSnapshot (computer storage)Genome projectComputational biologyWhole genome sequencingDatabase
Résumé présent dans OpenAlex
oui