MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2167731583 · doi:10.5539/jps.v3n1p65

Analysis of mRNA Levels of Ten Genes Under Water Stress in Triticum turgidum subsp. durum

2013· article· en· W2167731583 sur OpenAlexvenueno aff
Marouane Melloul, Driss Iraqi, Sripada M. Udupa, Gilles Erba, Moulay Abdelaziz El Alaoui, Mohammed Ibriz, Elmostafa El Fahime

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Studies · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National pour la Recherche Scientifique et Technique
Mots-clésGeneBiologyGene expressionDrought toleranceTranscription factorTriticum turgidumCell biologyGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drought is one of the major causes of dramatic yield loss in crop plants. Plants perceive and respond to stress. Upon perception of stress, a signal is communicated to downstream components resulting in change of gene expression and thereby of proteins required for the initial damage-repair and physiological re-programming for better adaptation. In this work, a set of 10 genes from Triticum turgidum subsp. durum, were tested for their expression under drought conditions. These drought responsive genes selected for expressional analyses can be classified into two groups. The first group includes functional proteins already known to be involved in the response to water stress such as late embryogenesis protein. The second group comprises protein factors involved in the regulation of signal transduction and gene expression, such as transcription factors. We have used the real-time quantitative PCR to monitor the expression patterns of these 10 genes in Triticum durum leaves under drought stress. The results showed a high quantitative up-regulation of some genes belonging to dehydrin, transcription factors (DREBS), cell wall polysaccharides and regulation of secretion categories. Moreover, the actin binding protein and an ethylene-responsive element binding factor genes were slightly down-regulated and not significantly affected by the drought stress. The result of this study extended our knowledge of drought induced genes and may provide better understanding of the molecular mechanisms of drought response inTriticum durum. Identifying genes turned on or off in response to water stress will help in enhancing drought tolerance and providing genes that can be tested by many biotechnology-based approaches. The long term objective of this study is to choose the optimum condition for subsequent whole transcriptomic analysis by cDNA-AFLP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,468
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Plant StudiesMême sujetPlant Stress Responses and ToleranceTravaux en français237 207