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Enregistrement W2167937389 · doi:10.1111/j.1574-695x.2007.00317.x

Posttranscriptional gene expression regulation in CpG-activated macrophages depends on FXR1P RNA-binding protein

2007· article· en· W2167937389 sur OpenAlexafffund
Claude Lachance, Thusanth Thuraisingam, James Garnon, Danuta Radzioch

Notice bibliographique

RevueFEMS Immunology & Medical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésTLR9BiologyChemokineTumor necrosis factor alphaGene expressionMessenger RNATLR7Molecular biologyLipopolysaccharideRNACpG siteRegulation of gene expressionReceptorCell biologyRNA-binding proteinToll-Like Receptor 9Proinflammatory cytokineToll-like receptorGeneInflammationInnate immune systemImmunologyBiochemistryDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An RNA-binding protein (RBP) was recently identified, FXR1P, which regulates tumour necrosis factor (TNF) gene expression at the posttranscriptional level in response to lipopolysaccharide, was recently identified resulting in higher TNF production in macrophages from FXR1 knockout (KO) mice compared with wild-type (WT) macrophages. In this study, the importance of FXR1P in the induction of TNF by toll-like receptor 7 (TLR7) ligand S28463 and TLR9 ligand CpG is evaluated. The results clearly reveal a much higher level of TNF protein expression in FXR1-KO than in WT macrophages following stimulation with CpG but not with S28463. To better understand the molecular mechanism, both the steady-state levels and the stability of TNF mRNA were assessed. It was found that the TNF mRNA steady-state level was more elevated in CpG-stimulated FXR1-KO macrophages, while the stability of TNF mRNA was not affected in CpG-stimulated FXR1-KO macrophages. It was also established that FXR1P is involved in regulating the expression of several other inflammatory cytokines and chemokines. Together, the data clearly demonstrate the importance of FXR1P RBP in the regulation of a wide spectrum of inflammatory genes and suggest an important role of MAP signalling in the response of macrophages to selected TLR ligands, including CpG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,872

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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