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Enregistrement W2168086696 · doi:10.1128/mcb.22.15.5319-5336.2002

Oxygen-Dependent Ubiquitination and Degradation of Hypoxia-Inducible Factor Requires Nuclear-Cytoplasmic Trafficking of the von Hippel-Lindau Tumor Suppressor Protein

2002· article· en· W2168086696 sur OpenAlexafffund
Isabelle Groulx, Stephen Lee

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyUbiquitinSuppressorCytoplasmHypoxia-inducible factorsNuclear proteinCell biologyHypoxia (environmental)Tumor suppressor geneF-box proteinCancer researchNuclear export signalNuclear transportCell nucleusTranscription factorMolecular biologyOxygenUbiquitin ligaseGeneticsGeneCarcinogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is becoming increasingly evident that the degradation of nuclear proteins requires nuclear-cytoplasmic trafficking of both the substrate proteins, as well as the E3 ubiquitin-ligases. Here, we show that nuclear-cytoplasmic trafficking of the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein (VHL) is required for oxygen-dependent ubiquitination and degradation of the alpha subunits of hypoxia-inducible factor (HIF-alpha). VHL engages in a constitutive transcription-sensitive nuclear-cytoplasmic shuttle unaffected by oxygen tension or levels of nuclear substrate HIF-alpha. Ubiquitinated forms of HIF-alpha, as well as VHL/ubiquitinated HIF-alpha complexes, are found solely in the nuclear compartment of normoxic or reoxygenated VHL-competent cells. HIF-alpha localizes exclusively in the nucleus of hypoxic cells but is exported to the cytoplasm upon reoxygenation. Oxygen-dependent nuclear ubiquitination and nuclear export of HIF-alpha can be prevented by treatment with an HIF-specific prolyl hydroxylase inhibitor. Treatment with inhibitors of RNA polymerase II activity, which interfere with the ability of VHL to engage in nuclear export, also prevents cytoplasmic accumulation of HIF-alpha in reoxygenated cells. This caused a marked increase in the HIF-alpha half-life without affecting its nuclear ubiquitination. We present a model by which VHL-mediated ubiquitination of HIF-alpha and its subsequent degradation are dependent upon dynamic nuclear-cytoplasmic trafficking of both the E3 ubiquitin-ligase and the nuclear substrate protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations184
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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