Antigen Potency and Maximal Efficacy Reveal a Mechanism of Efficient T Cell Activation
Notice bibliographique
Résumé
T cell activation, a critical event in adaptive immune responses, depends on productive interactions between T cell receptors (TCRs) and antigens presented as peptide-bound major histocompatibility complexes (pMHCs). Activated T cells lyse infected cells, secrete cytokines, and perform other effector functions with various efficiencies, which depend on the binding parameters of the TCR-pMHC complex. The mechanism through which binding parameters are translated to the efficiency of T cell activation, however, remains controversial. The "affinity model" suggests that the dissociation constant (KD) of the TCR-pMHC complex determines the response, whereas the "productive hit rate model" suggests that the off-rate (koff) is critical. Here, we used mathematical modeling to show that antigen potency, as determined by the EC50 (half-maximal effective concentration), which is used to support KD-based models, could not discriminate between the affinity and the productive hit rate models. Both models predicted a correlation between EC50 and KD, but only the productive hit rate model predicted a correlation between maximal efficacy (Emax), the maximal T cell response induced by pMHC, and koff. We confirmed the predictions made by the productive hit rate model in experiments with cytotoxic T cell clones and a panel of pMHC variants. Thus, we propose that the activity of an antigen is determined by both its potency (EC50) and maximal efficacy (Emax).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».